分集 共11集
《農大菌物語》第 1 季 分集劇情共 11 集
第1集：農大菌物語2007年10月12日
農大一年級新生澤木直保具有能看見菌的特殊能力。他發現學校某塊地裡不斷噴出大量菌，而且學校裡行蹤不明的女學生長谷川遙的姓名牌正插在那塊土地上，大騷動~~！！這時突然出現一個老人，他居然就是樹慶藏！
第2集：身價三億的農大生2007年10月19日
日本酒的天敵火落菌大量出現！澤木揪出了在學校內私自造酒的犯人川濱和美里。私自造酒失敗欠下大量現金的兩人將怎樣利用澤木的能力賺回酒館的集資呢？
第3集：菌們來釀造2007年10月26日
正在進行菌的培養的川濱和美里遭遇到有潔癖的及川，滅菌活動將發生怎樣的波折呢？另一方面，樹教授準備新建發酵倉並向大家演示了造酒過程，澤木的能力會帶來怎樣的影響呢？
第4集：到處都是菌慶典2007年11月2日
樹教授讓澤木和結城去學校的學校B1農場裡去偷蔬菜。今晚，入校的新生們第一次體會到了蔬菜小偷的感覺，而試驗田裡又有什麼等著他們呢？
第5集：怪異！菌怪2007年11月9日
澤木看見了一個全身被菌包圍的“菌怪”。在樹老師的承辦商日吉菊二的酒店裡。菊二向大家介紹了日本酒深奧的文化，還勸解澤木對能看見菌的能力要心懷感激。就在這時一個渾身發臭的女人武藤葵出現了。
第6集：神魂顛倒！Miss農大2007年11月16日
揹著各種發酵食品的武藤從陸路回國啦，這位外形亮麗的女生就是深受農大男生們的歡迎的女神。但是，澤木發現武藤帶回來的不止是發酵食物，還有病菌！農大中毒事件就此拉開帷幕…………..
第7集：開幕！農大春季慶典2007年11月23日
由一個全身著黑衣的怪人集團農士會舉辦的農大春季慶典正式開始啦！完全體現農大精神的活動要求學生與校外隔絕，學校自給自足。連農士會都不清楚的謎樣規則，春季慶典將怎樣發展呢？
第8集：農大正門攻克戰2007年11月30日
春季慶典最後一日，學生們對農士會開始了總攻擊，想入手樹教授發明的媚藥的美里和川濱也決定利用農士會的弱點趁亂髮起突襲。大亂戰中澤木將怎樣對陣農士會巨大的大將呢？
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第9集：附著在細嫩的皮膚上2007年12月7日
樹教授又邀請大家一起品嚐發酵食物了。而今天又是長谷川和父親見面的日子，她父親還是不放棄勸長谷川退學。懷著煩惱入睡的長谷川卻不知道她面臨著怎樣的危急！
第10集：哥特羅莉之吻2007年12月14日
澤木在日吉酒店的門口見到一個哥特打扮的少女。再見少女時卻被及川看見了驚人的一幕，他們居然在接吻！回研究室後澤木發現他的能力沒有了，怎麼會這樣？是因為那個吻麼？
第11集：閃耀的菌的未來2007年12月21日
美里和川濱還是和平常一樣對待沒有了能力的澤木。另一方面，澤木對長谷川的問題“要是一直看不見了怎麼辦”突然感到困擾。以好友螢傾訴煩惱的事作為契機重新凝視自己的人生的沢木，把自己的想法傳達給長谷川。