分集 共23集
《重返犯罪現場》第 2 季 分集劇情共 23 集
第1集：遙控罪行2004年9月28日
海軍的沃特森上校走進辦公室的時候，電腦裡出來一個奇怪的聲音，告訴他他的妻女已經被綁架，必須從戰略資金裡挪兩百萬才能救他們，他受攝像頭監視不能自由移動，於是將這些偷偷寫在紙上讓秘書告知NCIS。 蓋布斯假扮軍官去送資料將監視鏡頭安好，托尼則假扮送餐人員送去監聽耳機。凱特和麥基潛進沃特森上校的家裡，沒有發現強行進入的痕跡。這對母女很有可能是被騙走的，於是蓋布斯授意沃特森上校讓綁匪先放他的女兒。小女兒桑蒂是個盲人，可是有超乎尋常的聽力，她聽出了綁架地點，但是綁匪顯然不是主謀……
第2集：賢妻俱樂部2004年10月5日
施工隊挖出了一個隱藏的地窖，裡面有一具死去的乾屍，身上穿著新娘的服飾……這名女屍是一名海軍中尉，經過驗屍發現已經死亡兩年。屋裡的擺設和書籍都是五十年代的風格，Gibbs率領手下調查發現，很有可能是個迷戀五十年代完美妻子的變態殺手。
第3集：神秘失蹤2004年10月12日
一架超級眼鏡蛇直升機停在名叫煙角的小村莊的神秘麥田圈上，同時失蹤了兩個海軍陸戰隊員。當地村民都聲稱看到了極光，是飛碟來訪，但Gibbs堅信根本不是什麼超自然力量所為。McGee在樹林中發現一間被燒燬的小屋，裡面有一具被燒焦的人類屍體，經過檢測證實是一名失蹤人員。
第4集：歷史重演2004年10月19日
兩名士兵在路邊發現一具穿著上尉軍服的女屍，等到Gibbs一行到達現場，已經有人先行動過屍體。動過屍體的是一名海軍女少尉，她和McGee是舊識。Ducky在檢查屍體的時候發現了一個三叉戟的烙印，勾起了他的回憶，那是十年前一名一直無法確認身份的女屍，她的身上也烙印著三叉戟。
第5集：萬骨冢2004年10月26日
有個被捆綁的人醒過來發現自己被丟在了海軍陸戰隊的演習場，儘管他拼命奔跑，還是被演習的炮彈炸死了。 吉布斯他們來到現場，發現一個很無能的探員正在亂動現場，並且已經把案件初步定為非法闖入的意外傷害。吉布斯不理睬的他的結論，重新調查後發現，這裡不止一具屍體…… FBI的弗內爾突然來訪，原來炸死的那個人是FBI的臥底，他生前正在跟蹤一名黑社會頭目吉米，顯然是有叛徒出賣了他。在調查中，弗內爾也遭到陷害入獄，他被帶走之前請求吉布斯一定要找出叛徒……
第6集：退役風波2004年11月16日
退役海軍軍官麥奇在超市購物時遭到炸彈襲擊，倖免遇難。 麥奇在阿富汗戰爭中曾經誤炸平民，吉布斯懷疑這是一起伊斯蘭極端組織的報復行為。FBI再次插手，吉布斯暫時接受保護受害人全家的任務。在行動過程中，吉布斯找出了嫌疑人，但是FBI隱瞞訊息並且干預吉布斯審問犯人，而且置擔任保鏢東尼和凱特的性命於不顧。第二次爆炸又發生了，吉布斯利用FBI的把柄威脅了他們，雙方達成交易，罪犯順利收押。他們在開往總部的路上接到艾碧的電話，第二次爆炸用的炸藥很業餘，兇手還有第二個……
第7集：英雄夢魘2004年11月23日
一位老人找到NCIS總部，聲稱自己殺了人，吉布斯讓他過安檢的時候發現他是二戰的榮譽勳章獲得者，是硫磺島戰役的倖存者。 老人最近失去了相伴的老伴，由於悲痛很多記憶消失了，他不記得細節，但是堅持自己在二戰時殺了自己最好的朋友。吉布斯檢查了證物，沒有結論，申請了開棺驗屍，那具屍體失去了雙腿，頭上有一個被擊打的凹槽，和證物點45手槍的槍柄吻合，似乎證據確鑿了，海軍部決定羈押老人，但是吉布斯找了一個當年同在硫磺島的日本老人，他要嘗試重新喚起老人的回憶……
第8集：燃燒疑雲2004年11月30日
因心臟病住在海軍醫院的多南司令官突然在病床上自行爆炸了，似乎沒有多餘的線索能證明是他殺。司令官的主治醫生詹尼斯馬上就要退役了，這是她的最後一個心臟病人。吉布斯讓麥基檢查了醫院的錄影，在多年死亡時間裡出現了一名海軍少尉，吉布斯帶著凱特圍捕少尉，卻發現此名少尉正在嘗試自殺，凱特意外擊斃了他。他的教練是他生前最後一個談話者，他證明少尉在那段所謂的殺人時間一直和他在一起，少尉是無辜的，凱特陷入了自責。 艾碧模擬了引爆過程，證實是輸氧管爆炸。爆炸之前詹尼斯醫生照顧過他，可是怎麼點火仍舊是個謎團……
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第9集：色魔入侵2004年12月7日
在海軍駐地，有人闖進羅溫斯太太的家企圖強姦，羅溫斯開槍擊中了他。吉布斯來到現場，發現沒有強行進入的痕跡，羅溫斯太太聲稱從來沒有見過被她擊中的人。Tony和kate來到醫院給強姦犯拍照，強姦犯突然甦醒，說自己是被邀請去羅溫斯家的，他們在一個色情網站相識而相戀。
第10集：臥底行動2004年12月14日
東尼到監獄做臥底，在和海軍重犯懷特一起押送的過程中，他們製造了一起逃脫事故。 因為懷特至今沒有招供他在伊拉克偷運的古董的下落。懷特生性多疑，他製造了一次車禍，讓東尼和總部失去了聯絡，聰明的東尼到處留下暗號…… 副國務卿一直在打電話詢問，不勝其煩的麥基在吉布斯的授意下終於讓對方閉了嘴。凱特得到了新的線索，原來懷特不僅僅是盜竊犯，手上還有三條人命，並且殺人手段及其殘忍，眾人為東尼深深擔憂。 循著東尼留下的記號，凱特他們追蹤到了東尼的車，但是車裡的東尼已經向懷特表明了身份，不動聲色的懷特偷偷取出了刀……
第11集：真相大白2005年1月11日
失蹤了兩年的海軍上尉布萊恩的屍骨意外被發現，他和自己的車一起沉在黑湖裡。在此之前他的家人懸賞100萬尋找他。在屍檢過程中發現了子彈，布萊恩的弟弟湯姆成了最大的嫌疑人。發現屍體的是著名私家偵探庫伯，他不厭其煩的找到吉布斯，展示自己的證據，希望吉布斯可以結案。
第12集：詐死2005年1月18日
銷售公司的銷售員正在向海軍下士蘭波特推銷服務，卻意外發現對面傳來異常的聲音。吉布斯來到現場，屋裡到處是打鬥的痕跡，蘭波特下士不知所蹤，現場跡象似乎是被謀殺。
第13集：人肉拼圖2005年2月8日
Ducky收到的人肉碎塊終於拼成了三具屍體，他們的身份很快確認，是當年Ducky作證的一起強姦殺人案的檢察官，法官，陪審團主席，兇手是一名想成為驗屍官的醫學院學生文森▪漢蘭。吉布斯和凱特來到漢蘭家，被告漢蘭已經在一年前的車禍中死亡。
第14集：目擊證人2005年2月15日
一個女孩報案說住在她樓對面的海軍被人勒死了，可是警察卻在現場找不到任何痕跡，吉布斯讓麥基去現場看看有沒有調查的價值。托尼和凱特在模擬現場時發現了可疑的人類尿液，經過仔細搜查，找到了很多藏匿的現金。
第15集：捕捉入鏡2005年2月22日
在雪蘭多國家公園，一名叫摩爾的海軍中士從山崖墜下身亡，身上有被狼咬過的痕跡。目擊證人只有摩爾的妻子和最好的朋友，他們告訴吉布斯摩爾在失蹤之前和公園裡的流浪漢有過沖突。艾比在死者頭上找到了棒球棍的特製木料，摩爾是被謀殺的。
第16集：絢爛人生2005年3月1日
海軍中尉阿曼達被人殺死，奇怪的是嫌疑犯竟然沒有逃走，而且滿手鮮血的來開門……嫌疑犯堅決聲稱自己是無辜的，認為死者並不是和自己一夜情的那個女孩，那個女孩是在酒吧跳豔舞的舞女。艾比也證實雖然嫌疑犯滿手都是血，可是兇器上卻沒有指紋。
第17集：巴拉圭眼珠奇案2005年3月22日
有人把一對人類眼球寄到了海軍中士本傑明家裡，但是本傑明不承認自己和這些有關。東尼和凱特負責在他門外監視，本傑明在家裡自殺了。本傑明自殺前曾給自己的老師普塞爾打過電話，他是海軍退役上校，也是海軍學員秘密行動的講師，同時還是在巴拉圭活動的雙重間諜。眼球的主人被確認是一個17歲的女孩，她還有一個身份是普塞爾的妻子。
第18集：比基尼兇殺案2005年3月29日
在維吉尼亞海灘，一場泳裝秀正在進行，三號選手突然失蹤，她的屍體被一位老太太在廁所發現。死者是海軍中士蒂弗尼喬丹，死前打給一個叫莉莎的瑜加教練打過電話，但是莉莎堅稱蒂弗尼只是自己的一個學生。有一個已經出獄的男人給蒂弗尼寫過很多信，可是此人卻有完美的不在場證明。
第19集：峰迴路轉2005年4月12日
住在精神病院的海軍中尉潔西卡總是被夜晚魔鬼一樣的聲音威脅，吉布斯帶著眾人前去調查，沒有發現任何異樣，傑西卡的主治醫生維特上校堅持只是精神問題。 潔西卡得病之前在海軍得秘密機構工作，吉布斯懷疑有內情，再次來到精神病院，一名叫凱瑟琳的病人主動介紹了情況。潔西卡的上司韋德上校被控在政府交易中收取回扣，卻從來沒有找到證據，吉布斯找到他，他卻堅持自己是清白的，和潔西卡也是父女一樣的關係。 潔西卡說有東西在她房間，等到吉布斯趕到的時候潔西卡已經在病房上吊自殺了，但是艾碧發現這是佈局精巧的謀殺……
第20集：校園殺機2005年4月26日
一天深夜，海軍學員們正在舉行兄弟會測試，一名學院偶然發現了一具脖子被折斷的屍體。 死者是海軍學院的特納，他的死亡方式顯示是海軍陸戰隊的手法，他的隊友布雷克成了最大的嫌疑犯，因為他同時失蹤了。艾碧的電腦被駭客侵入了，麥基循著訊號追蹤，竟然找到了布雷克的屍體，死亡方式和特納一樣。電腦駭客被抓，他告訴吉布斯他們兩個有一個共同的女友艾希莉，很有可能是爭風吃醋致死。可是艾希莉告訴他們，兩個人在幾天前在幫她躲避教官黎卡的騷擾……
第21集：遺骨謎團2005年5月3日
海軍陸戰隊士兵托布斯為了救戰友死在了伊拉克戰場，他的朋友艾米幫忙整理他的儲物倉時，卻在儲物倉裡發現了屍體，經過監測，是他青梅竹馬的朋友諾拉，在兩年前失蹤。 海軍調查委員會命令吉布斯查出真相，如果屬實，會撤銷托布斯的榮譽獎章。當地警長和諾拉的父母都認為是托布斯殺了諾拉，因為在諾拉失蹤之後托布斯突然參軍去了，而且屍體又在他租的儲物倉發現，但是吉布斯並不盲從。 凱特和吉布斯去詢問了艾米，艾米的回答沒什麼價值，之後竟然割腕自殺了，案情越來越撲朔迷離，這個時候，一段模糊的車庫錄影帶來了希望……
第22集：唇印殺機2005年5月10日
NCIS總部收到一封印著唇印的信，東尼搶著打開了，裡面跑出了白色的粉末，他們迅速被隔離，東尼因吸入粉末成了受害者和患了感冒而免疫系統變弱的凱特一起進入隔離病房。 粉末被證實是鼠疫病毒，艾碧和馬拉德讀了那封信，裡面要求NCIS公開幾年前的一個案件，是一起海軍強姦案，罪犯至今逍遙法外。強姦案的受害者是一名叫薩莎的女孩，她的母親漢娜是生化研究機構的執行總裁。吉布斯逮捕了漢娜，漢娜說自己只是想要公道。 只有東尼被感染了，病菌被證實是不能複製的，但是隻有百分之十五的生存率。薩莎終於坦白當年的強姦案自己說謊了，可憐的東尼只能靠自己的運氣了……
第23集：血色黃昏2005年5月24日
兩名海軍飛行員在度假途中被殺，其中一個被剁去了雙手，吉布斯他們去調查，又險些被汽車底盤藏著的炸彈炸死，很顯然他們被算計了。 追查工作進行的很艱難，炸藥的成分，匿名的911電話，都是沒法追查的，只能是職業特工所謂，正在此時FBI到訪，原來阿里秘密回國了，他已經脫離的FBI的掌控，他這次回來的目標是殺死吉布斯！凱特被臨時任命保護吉布斯。一架小型的可以裝載炸彈的遙控飛行器被盜，現在知道為什麼飛行員會失去雙手了，因為中心的門是靠掌紋開啟的。此時海軍的大型艦艇就要靠岸了，很容易猜到恐怖分子要幹什麼，阿里早已不是什麼雙面間諜，現在他是徹頭徹尾的恐怖分子！船就要靠岸了，飛彈已經飛出，吉布斯他們只能儘量阻止悲劇發生……