幻彩守護星 第 2 季
2000-04-13 首播 · 共26集
古羅沙被初期化後，以為回覆和平的網路世界突然受到名為巴古病毒的入侵。中學生春日結再次被安排進入網路世界變身成守護星阿結；另外不知道從何處來名為“守護星阿愛”的人登場，她的目的是要找一個名為阿愛的小女孩，而這個小女孩阿愛正好又跟巴古病毒連上關係……
這一季暫時沒有可播放的線路。
《幻彩守護星》第 2 季 分集劇情共 25 集
第2集：已經不需要Collector Yui了嗎！？2000年4月20日
Collector專用聊天室啟用，Yui等人接連趕往發生Buglus的網路，卻每次都被神秘Collector Ai搶先處理。Yui懷疑Ai使用的是被盜的新型ComCon。事件結束後，Yui認識了剛搬到隔壁、聲稱是瞬表妹的篠崎愛。
第3集：迷路的少女2000年4月27日
Freeze在沙漠網路打工時看見獨自行走的神秘少女，隨後Buglus出現。管家打扮的老人委託Freeze秘密尋找少女。Yui也在尋找Ai，偶然遇到Freeze。少女再次引發Buglus，Ai趕到並協助消滅病毒，但少女和Ai隨後消失。
第4集：Yui與愛的戲劇對決2000年5月4日
Yui臨時代替受傷的劇團部長，與愛共同排練。演出當天Buglus出現，Yui被困，愛拿出ComCon變身Collector Ai救出Yui。兩人利用排練形成的默契擊退Buglus，Yui更加懷疑愛就是Ai。
第5集：目標！成為漫畫家2000年5月11日
Yui決定參加新人漫畫大獎，卻在截稿日被Buglus事件拖走。她進入時代劇網路追查病毒中心，成功Initialize，卻因疲勞睡著而錯過投稿截止時間。
第6集：零下200℃的戰鬥2000年5月18日
Yui因分心救小狗讓夥伴陷入危險，Synchro責備她，她又因被拿來與Ai比較而鬧情緒。夏山滑雪網路發生Buglus，溫度驟降。Yui最終認識到錯誤，與Synchro重新合作，並在Freeze幫助下擊敗雪人形Buglus。
第7集：占卜！受歡迎的條件2000年5月25日
Control為了調查Buglus規律而向Anti求助。一太郎為了受女生歡迎參加戀愛占卜，導致校園掀起模仿潮。Yui調查後發現Anti網路遭汙染，最終救出Control，並得知Buglus發生前會出現類似太陽的影像。
第8集：追趕太陽！2000年6月1日
Yui尋找“太陽”線索，進入童話網路。太陽角色因接觸神秘少女而感染Buglus並巨大化。Yui等人無法靠近，Follow假扮Yui將太陽引到海邊，成功Initialize。犬養博士要求Ai交還ComCon，但Ai表示時機未到。
第9集：Yui要成為偶像了！？2000年6月8日
Yui在“快樂晚年人生規劃網路”調查Buglus後被捲入病毒，醒來卻發現自己成為聲優、歌手並準備開大型演唱會。她看到現實中不應出現的IR，意識到這是虛擬夢境。Ai幫助她找到病毒中心，Yui最終親手Initialize。
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第10集：消失的Netty2000年6月15日
Eco報告Netty失蹤。Yui在恐怖網路發現被遺棄的寵物軟體，Netty原來留在那裡照顧它們。Buglus感染Netty，Yui找到病毒中心並Initialize。博士將該網路併入Eco的自然體驗網路，讓Netty繼續照顧被遺棄的軟體動物。
第11集：Freeze的校園日記2000年6月22日
Freeze因打工失敗被解僱，決定體驗校園生活。Yui為調查Freeze的能力也進入學校。神秘少女出現後Buglus讓校園空間混亂，Yui與Ai找到病毒核心並Initialize，Freeze則因考試成績太差被退學。
第12集：愛的私人課程2000年6月29日
Yui因不會熟練操作鍵盤而被同伴嫌棄，在犬養博士安排下接受愛教授打字。網路發生Buglus後，Yui必須輸入密碼開啟通道，在Ai協助下成功完成任務。愛無意說出與Ai相同的話，Yui更加確信兩人是同一人。
第13集：Peace大暴走！？2000年7月6日
Yui懷疑愛就是Ai，卻沒有證據。新的Buglus事件中出現大量超規格武器，調查發現有人盜用了Peace的資料。偽裝成Peace的程式與Freeze衝突並引發巨大機器人Buglus。Yui與Ai合作擊敗它，Peace繼續調查資料被盜事件。
第14集：Yui，去溫泉旅行吧2000年7月13日
Freeze騙Synchro說溫泉可能讓他恢復原貌，眾人來到溫泉網路。Synchro泡溫泉後短暫恢復人形，卻無法穩定維持。溫泉感染Buglus併吞噬遊客，Yui將其Initialize。博士由此確認Buglus中可能存在讓Synchro恢復的方法。
第15集：八小時環遊世界2000年7月20日
學校遠足進入世界旅行網路。迷路少女出現後，大家發現她正在尋找“向日葵”。少女因害怕與Yui等人分離而哭泣，巨大植物Buglus隨之出現。Yui與夥伴擊敗病毒，開始意識到少女與Buglus之間存在直接聯絡。
第16集：決定了！Collector春菜2000年7月27日
Yui在戰鬥中被Buglus石化，博士表示20小時後會完全石化。春菜決定成為Collector尋找核心。她再次遇到迷路少女，隨後巨大蟲形Buglus出現。春菜利用各Collector能力，與Ai合作Initialize病毒，使Yui恢復。
第17集：Yui戀愛了2000年8月3日
Yui愛上網路上認識的大學生浩介。大家發現浩介因交通事故住院，無法繼續踢足球。Yui等人進入體育網路幫助他恢復信心，Buglus襲擊時浩介保護護士並重新踢球。Yui後來發現浩介與護士是戀人，並在醫院發現與愛有關的舊照片和迷路少女圖畫書。
第18集：Jaggy圖書館大騷動2000年8月24日
Yui確認迷路少女出現在圖畫書中。Collector們重新調查Buglus發生地點，卻發現少女沒有訪問記錄。少女來到Jaggy管理的圖書館，熊玩偶突然活動，隨後書中內容實體化為Buglus。Yui消滅病毒，春菜再次跟丟少女。
第19集：向日葵中的少女2000年8月31日
Yui和春菜找到愛母親住院的線索，並得知圖畫書與愛有關。Collector們舉辦向日葵展誘出少女。少女因爭執哭泣，立即產生向日葵Buglus。Yui與春菜將其Initialize。Virus發現所有Buglus都含有與少女眼淚相關的成分，少女可能正是病毒源頭。
第20集：三位Collector登場！2000年9月7日
3D摔跤網路出現Buglus，Yui、春菜、Ai共同出擊。調查發現管家向相關人員交付裝有少女眼淚的瓶子。Collector們開始意識到幕後有人在利用少女眼淚製造Buglus。
第21集：悲傷的Freeze2000年9月14日
新的Buglus實際上是人為製造的偽裝體。Collector追查管家，Freeze被其綁架並利用。Freeze原來受託尋找迷路少女，且她擁有電腦病毒探測能力。被Buglus控制後，她被迫追捕少女，最後在Jaggy幫助下恢復意識，並請求Yui連同自己一起刪除。Freeze的眼淚讓Buglus短暫停止，Yui成功Initialize她。熊玩偶隨後請求大家“救救i”。
第22集：Collector Ai的真實身份2000年9月21日
Yui等人繼續尋找迷路少女與Ai的真相。愛長期進入ComNet後住院，卻仍獨自尋找少女。Western Net發生Buglus，Ai與Yui交換ComCon並共同戰鬥。戰鬥中Ai的ComCon損壞、變身解除，Yui終於確認Collector Ai就是篠崎愛。
第23集：愛、Ai與i2000年9月28日
犬養博士解釋熊玩偶的來歷：i是ComNet早期開發的郵件軟體，曾被幕後人物綁架並長期關在病毒房間，病毒在i體內變化成Buglus。愛昏迷後Buglus進入她的內心，Yui進入愛內心的記憶，發現愛幼年與父母及圖畫書的聯絡。
第24集：ComNet最大的危機2000年10月5日
調查顯示半年前的事故與i的眼淚製造的Buglus有關，幕後人物一直利用不同網路測試病毒。Yui為了保護愛拒絕直接Initialize i。強力Buglus感染Collector們並讓他們互相攻擊，Ai重新幫助Yui與春菜。升級ComCon讓Yui獲得Advanced Element Suit並用Hyper Initialize消滅病毒，但整個ComNet隨即出現大量Buglus。
第25集：ComNet要崩潰了！？2000年10月12日
Buglus繁殖速度超過Initialize速度，現實世界也開始受影響。博士調整ComNet時間爭取時間，Collector們決定尋找病毒源頭i。被Buglus控制的管家出現，Yui等人最終找到愛母親和幕後人物黑川良，得知他企圖摧毀現有ComNet。
第26集：大家都是朋友2000年10月19日
黑川良曾與愛父母共同參與ComNet計劃，卻因“軟體不需要感情”的理念分歧被排除。事故後他的意識與Buglus結合，企圖摧毀舊ComNet。黑川控制Collector們，Yui無法直接Initialize夥伴。最終Yui集合所有Collector、春菜和Ai的力量，獲得Final Element Suit並擊敗黑川。i原來是愛父親參考圖畫書製作、準備寄給愛的一封郵件。愛擁抱i並讓它完成使命，母親恢復意識。故事最後Yui、Haruna、Ai繼續作為朋友。