分集 共6集
《潘朵拉的果實 科學犯罪搜查檔案》第 2 季 分集劇情共 6 集
第1集2023年6月25日
元少年犯罪者的交通引導員別所突然兇暴化，以超人般的怪力慘殺 5 人後力竭身亡，科學犯罪對策室展開調查，新成員奧田玲音（吉本實憂）加入團隊。調查發現別所半年前曾接受最上的恩師 —— 研究者九龍（升毅）的疫苗接種，而九龍所屬的 “萊登集團” 研究機構在案發時已失蹤，小比類卷著手追查九龍的研究內容，最上負責遺體 DNA 鑑定，案件背後似乎隱藏著更大的秘密。
第2集2023年7月2日
小比類卷等人與公安搜查官手冢在九龍的遺體旁撞見神情恍惚的最上，公安以殺人嫌疑追捕逃亡的最上。對策室在追查別所兇暴化原因的同時，也試圖證明最上的清白，此時發現另有多名元少年犯罪者曾接受九龍的疫苗接種。在對這些人進行詢問時，其中一人突然兇暴化後死亡，逃亡中的最上與小比類卷接觸，請求他調查神秘的 “帕克斯計劃”。
第3集2023年7月9日
戴狐狸面具的男子持獵槍闖入餐廳，劫持婚活派對參與者和店員為人質，在場的厚勞省官員三枝（佐藤隆太）也捲入其中。公安斷定犯人是元少年犯罪者三浦，小比類卷得知後大驚 —— 三浦同樣接受過九龍的疫苗接種，還是涉及法務省、厚勞省的基因編輯犯罪者矯正專案 “帕克斯計劃” 的受試者。對策室成員急赴現場，最上則試圖鎖定引發兇暴化的因子，而手冢背後似乎另有圖謀。
第4集2023年7月16日
交通事故車輛中發現兩具遺體，DNA 鑑定顯示其中一具屬於 62 歲議員葛原，但遺體外觀卻是少年，且缺少一個腎臟、頸部埋有微晶片，小比類卷推測這是 “用於器官移植的克隆人”。另一具遺體的線索指向萊登集團日本支部的澤田（平山浩行），他被認為是九龍被殺的幕後指使者。現場另有一名少年失蹤，此時追蹤萊登集團已久的自由記者郡山（深水元基）接近小比類卷和最上，帶來了令人震驚的情報。
第5集2023年7月23日
最上剛解析完晶片資訊，直樹就被澤田的手下綁架。解析結果顯示直樹的原型是與椿關係密切的富豪田部，田部患肺癌臥床卻在 5 天前由神經外科醫生鮫島（阿部翔平）安排轉院，行蹤成謎。小比類卷直覺萊登集團的目的不止於器官移植，而成功擄走直樹的澤田開始了 “恐怖實驗”。對策室成員、三枝與凱恩的行動交織，最終決戰揭開克隆計劃的真正意圖與國家層面的陰謀。
第6集2023年7月30日
直樹在卡爾・卡恩別莊被萊頓集團擄走，最上為保護他身受重傷。最上解析晶片得知直樹的原型是與萊頓顧問椿文治交好的富豪田部正明。調查發現田部曾患肺癌，其轉院手續由腦神經外科醫鮫島辦理。小比類卷等人發現萊頓集團的最終目的是通過克隆與腦移植實現 “不老不死”，最終眾人聯手阻止了澤田與鮫島的實驗，揭露了國家層面的腐敗與萊頓集團的罪行。