分集 共21集
《尋骨線索》第 2 季 分集劇情共 21 集
第1集：鐵軌上的泰坦2006年8月30日
一輛載有聯邦參議員列車與世界著名商業大亨駕駛轎車相撞導致出軌這兩個聲名顯赫人物當場死亡Brennan和Booth奉命調查這兩人此案中否有關聯犯罪現場們遇到了Jeffersonian新領導人Camille（Cam） Saroyan博士Brennan和Cam兩個女人起了衝突Booth從中調解試圖勸說Brennan相信Cam會有些幫助，之後Booth瞭解到這名大亨一家醫院裡從超速行駛車裡甩了出來僥倖生還卻成了植物人但還戴著自己冠軍戒指令Brennan懷疑也與案件有關車裡那名假冒者戴著大亨手錶和結婚戒指唯獨沒有冠軍戒指難道大亨本人主動參與了此事？Booth和Brennan返回去詢問私人偵探因為股票醜聞曝光之後唯一一個與大亨關係親密並有殺人嫌疑人但Booth和Brennan沒有足夠證據來逮捕
第2集：海灣的母子2006年9月6日
德拉瓦海灣發現了一具女性和胎兒遺骸，Booth和Brennan奉命前去調查屍體身份，被證實為一年前神秘失蹤Carlie Richardson，失蹤時候剛剛結婚，並懷有身孕。當時各大媒體曾爭相報道這條爆炸新聞，Carlie的丈夫Kyle Richardson被認為本案首要犯罪嫌疑人，但就Booth和Brennan打算訊問時，也失蹤了。Booth不得不申請對Kyle的搜捕令。
第3集：裹屍布中的男孩2006年9月13日
一輛垃圾車翻車現場，Brennan和Hodgins趕來參與，Booth和Cam調查垃圾堆中有一具包裹袋子裡裝有年輕男子屍體。Brennan發現頭骨破碎，腿骨斷裂，Hodgins則認為被害人垃圾堆中至少掩埋了三個星期。回到實驗室Angela通過屍體面部印記，鑑定了屍體身份。與此同時Brennan和Cam因為工作方式不同經常產生矛盾相互間關係也變得很緊張對於同樣強硬CamBrennan有時只能退縮求全因為兩人關係僵硬到極點時候Cam威脅說要找人來取代Brennan對於那些Jeffersonian精英們來說這不僅意味著損失也意味著們必須要大小兩個老闆中選擇支援一方
第4集：遊戲中的金髮女郎2006年9月20日
Booth和Brennan挖掘出一具年輕女孩遺骸時，意識到這次他們所遇到不僅僅一起簡單謀殺案，實驗室裡Hodgins，Zack和Cam相繼證明了這一點。他們發現兇手很可能是Howard Epps，一個關押了許多年的連環殺手。Brennan審判中曾出庭作證Epps，使他最終被判處死緩。
第5集：謊言中的真相2006年9月27日
Booth剛剛與前女友Rebecca床上親熱，卻接到了Brennan打來電話。Brennan顯然對這個女人沒什麼好感……電話中談起了最近一起案件，並要求Booth到案發建築工地上與其會面，這棟房子只建造了一部分，然後就有人發現一具，過著雙重生活，表面上看起來這就一個因妒生恨並且有意騙取保險賠償金的案子。但新出現線索讓Brennan和Booth對破案方向產生了分歧，第三嫌疑人浮出水面……Booth和Brennan的新上司，即前女友Cam，在此集末尾親熱。
第6集：2103號房間中的女孩2006年10月4日
邁阿密一家酒店裡發現了一具被燒死女性屍體，Brennan和Booth接到電話後，立即趕往案發現場。有跡象表明，這是哥倫比亞販毒組織所為，他們的目標是哥倫比亞司法代表，Dolores Ramos法官，美國國務院官員Alex Radziwill介入此案，堅決要求對Ramos法官所採取一切行動以及整個案件調查都要由他說了算。官僚作風給Brennan和Booth調查帶來了很多麻煩和不便，甚至們即將取得關鍵資訊時候起了阻礙作用。Ramos丈夫和兒子進入了兩人調查範圍，而這起謀殺案背後真相遠遠超出他們的想像，更意料不到的事，國務院並不想協助他們破案，目的是為了保護兇手。
第7集：捲髮的女孩2006年11月1日
該團隊調查了一名 10 歲的選美明星的死亡。其他參賽者、他們的父母和他們的兄弟姐妹都成為可能的嫌疑人。霍金斯和安吉拉的約會實際上進展順利，儘管其他人都預料到了。
第8集：沙中的女人2006年11月8日
五年前失蹤聯邦檢察官Mason Roberts遺骸在拉斯維加斯城外沙漠裡被人發現。Brennnan和Booth均懷疑死與犯罪集團有關，一隻禿鷹行蹤引領們發現了幾碼外另一具屍體：一個年輕女人新近剛被人埋下Booth認為兩起案件同一人所為，但女性被害人身上所受傷顯示長期遭到家庭暴力，虐待丈夫可能該對死負責。
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第9集：飛船上的外星人2006年11月15日
一對五年前遭綁架雙胞胎少年屍體在賓夕法尼亞州被人發現，Booth和Brennan認為這和臭名昭著連環殺手Grave Digger有關，這個惡魔慣用手法就綁架、活埋受害人，然後簡單地索取高額贖金，如果錢不指定時間內支付，到位將切斷聯絡，並留下受害人慢慢窒息而死。調查中Brennan和科學助手Hodgins成了Grave Digger下一個目標，他們不得不不見天日墓穴裡來解決自己綁架問題！
第10集：樹林裡的無頭女巫2006年11月29日
Brennan和Booth在喬治·華盛頓國家森林中艱難地穿行著，一名森林巡邏隊員領他們來到犯罪現場路上。Brennan發現一些很古怪小型手工飾品掛在樹上，護林隊員說起了Maggie Cinders的傳說－－據稱18世紀80年代，一個女巫自從被人斬首之後，當地人認為鬼魂仍然附著樹上的那些裝飾品中，徘徊於森林之中，尋找自己頭顱，任何人只要接近鬼魂就會被殺。護林隊員指著一條溝，讓Brennan和Booth看，裡面躺著一具無頭屍體。Brennen初步斷定一位18－25歲左右男性，還發現了一個攝像機。
第11集：柱子上的猶大2006年12月13日
一個男人在旅館屋頂被人射殺，兇手用衣服上帽子遮著自己臉，將受害者綁十字架上，掏出內臟給澆上油將其點燃……
第12集：牢房裡的人2007年1月31日
監獄官Everett帶著Brennan和Booth穿過監獄走廊，來到發生大火牢房前，牢房裡仔細檢查了已經燒焦屍體，Brennan早上醒來時候有些精神不振，因為昨天夜裡隔壁公寓進行裝修工匠們整晚都鬧個不停，但當監獄官打電話來說 Howard Epps 牢房發生了火災，她立刻睡意全無。
第13集：鱷魚腹中的女孩2007年2月7日
Brennan 必須與另一位特工合作，而 Booth 需要看治療師。二人組調查了一名大學新生的死亡，他參加了“Girls Gone Wild”型別的影片。
第14集：豪宅中的男人2007年2月14日
布斯和布倫南調查傑斐遜派的主要捐助者之一特倫斯·班克羅夫特 (Terence Bancroft) 的死因，他被發現死在家中。霍金斯多年前與死者妻子的關係使案件妥協。
第15集：書中的屍體2007年3月14日
布倫南和布斯必須解決三起與布倫南新暢銷書中的謀殺案相同的謀殺案。
第16集：河邊的無骨新娘2007年3月21日
該團隊調查了一名亞洲婦女的死亡，發現她體內沒有任何骨頭。
第17集：墓地裡的牧師2007年3月28日
一條破水管將舊墓地中的多具棺材連根拔起。當團隊被帶去確定重新安葬的屍體時，他們發現了一個不應該在墓地裡的較新的骨架，它已經有 50 年沒有使用了。
第18集：混凝土中的殺手2007年4月4日
Booth 和 Brennan 調查了在水泥中發現的部分骨架的案例。布斯認為犯罪家庭的成員應該對此負責。
第19集：隕石坑中的太空人2007年5月2日
布倫南和布斯被叫到在火山口發現死人的現場。調查將他們帶到國家航天局。
第20集：老石屋裡發光的骨頭2007年5月9日
小組調查一具發光的屍體。霍金斯多次向安吉拉求婚。
第21集：水坑裡的觀星者2007年5月16日
當安吉拉畫了一個老婦人的臉和一個年輕得多的人的腐爛骨架一起去時，他們很快得知受害者患有早衰症，一種衰老疾病。布斯和布倫南展開調查，發現誰會想要殺死這樣一個脆弱的人。與此同時，霍金斯和安吉拉走在過道上並沒有按計劃進行。