分集 共15集
《醫妃難囚》第 3 季 分集劇情共 15 集
第1集：細作醫妃“回孃家”2020年2月27日
熱布哈迪帶一行人回到南炎，蘭若溪本想治療納蘭百川，結果當場就被下了大獄。南炎太醫張白醜奉命給納蘭百川診治，結果醫術不精，全無效果，惹得熱布哈迪發怒，要把他和蘭若溪一同生祭。幸好有小六子拼死進言，熱布哈迪便準了蘭若溪醫治。蘭若溪成功穩住了納蘭百川的病情，同時也為自己爭取到了活命的機會。亓凌霄醒來後得知蘭若溪劫走納蘭百川，無奈之下，請皇帝下詔，說蘭若溪是南炎細作，她趁熱布哈迪圍城之際，劫走欽犯納蘭百川，現褫奪其太子妃身份，想以此保她在南炎的安全。
第2集：直男世子也有柔情一面2020年3月5日
亓凌雲從戰場歸來，聽聞太子妃被廢一事，追問亓凌霄卻得到蘭若溪從一開始就在利用自己的答案，不由心碎。此時蘭若溪用藥暫時控制了毒素蔓延，在此期間還要應付熱布哈迪對自己的質疑和審問，只能撒謊，稱大婚是為了偷兵防圖，而偷圖是與傾城合作的，傾城派影衛偷襲則是因為合作崩盤。但熱布哈迪精明異常，險些就揭穿了蘭若溪的謊言，就在危急之時，熱布哈迪舊傷發作，暈了過去，蘭若溪為其診治，同時也躲過了一劫。蘭若溪大膽考慮啟用射罔以毒攻毒，並要親自上山去採烏頭。但蘭若溪遇到了刺客偷襲，一直在暗中跟隨的熱布哈迪出手救下蘭若溪。
第3集：花痴郡主結緣翩翩神醫2020年3月12日
王后突發頭痛，熱布哈迪帶著蘭若溪前去。王后不喜看病，蘭若溪通過望、聞、問來判斷王后的頭痛是自內而致，為她開了藥方，王后讚賞她的醫術。蘭若溪還從半夏口中得知了王后有夜遊症，蘭若溪夜裡便悄悄溜進王后寢宮，發現王后床邊點了根安神香。蘭若溪覺得安神香對診脈有影響，便滅了它。王后卻突然醒來，向兩人求救。與此同時，顧西風也來到了南炎，在街頭免費施藥。俠醫顧西風的名聲很快就傳進了南炎王宮，仰慕顧西風的半夏聽說後便把顧西風帶進了王宮中。蘭若溪見到顧西風開心不已，便帶顧西風來到醫館，此時館中只有他們兩人，蘭若溪問顧西風可有亓凌霄帶給自己的訊息，顧西風卻強勢吻了她。
第4集：身份互換後的錯亂一吻2020年3月19日
蘭若溪被強吻後打了顧西風一個耳光，結果顧西風摘下了易容面具，竟是亓凌霄。而真正的顧西風，此時正在東臨太子府中強撐著假扮亓凌霄。亓凌霄和蘭若溪互訴思念之情後，亓凌霄便發現牆上全是納蘭百川為紀纖雲畫的畫像，醋意大發。蘭若溪連忙表示納蘭百川只是崇拜紀纖雲的醫術。亓凌霄要帶蘭若溪即刻離開，但蘭若溪卻想把納蘭百川治好後再走。亓凌霄雖然不爽，但也咬牙決定陪著她。熱布哈迪來到醫館，親自接見顧西風。而偽裝成顧西風的亓凌霄也對熱布哈迪滿懷殺意。為避人耳目兩人不得不分房睡。到了晚上亓凌霄卻忍不住相思之苦偷偷跑到了蘭若溪的房間，結果卻被突然到來的半夏嚇得躲到了床底下，悲慘地過了一夜。
第5集：直男求愛大作戰2020年3月26日
熱布哈迪見“顧西風”每天跟蘭若溪黏在一起，舉止太過親暱，便莫名地看他不爽。半夏說熱布哈迪是喜歡上了蘭若溪。他自信沒有拿不下的獵物，不顧半夏的阻攔，當即跑到醫館去向蘭若溪表明心意，說自己看上她了，擇日就娶她為妃，卻被蘭若溪婉拒。亓凌霄見熱布哈迪當著自己的面向自己的女人表白，醋海翻波。另一邊，熱布哈迪生平第一次在女人面前如此受挫，和武將們在演武場操練時，把氣全撒在了他們身上。蘭若溪一通好勸，終於平息了亓凌霄的怒火。另一邊，熱布哈迪也召集了將士，如同行軍作戰一般，開始了“兵法追妻”，並派出半夏作為探子，探查蘭若溪的喜好。亓凌霄生氣無比，但無論熱布哈迪如何使招追求，蘭若溪依舊不為所動。
第6集：太子夫婦慘遭修羅場2020年4月2日
熱布哈迪看見蘭若溪給顧西風挽袖子，醋意大發。熱布哈迪為爭奪蘭若溪便表演了一番兵器雜耍。亓凌霄則用激將法，激得熱布哈迪主動搬走了上百斤的醋罈子，熱布哈迪後知後覺，晚上才反應過來自己被耍了。熱布哈迪把蘭若溪約到了校場來，向她展示自己的雄師是如何之英武雄壯，還專程握著蘭若溪的手教她射箭，就在箭向靶心射去時，突然出現的亓凌霄一手截住了射出的箭。緊接著熱布哈迪與亓凌霄一番武力對決，良久，竟不分高下，各自負傷。蘭若溪氣極，拖了兩個人去醫館治傷，熱布哈迪卻莫名興奮不已，終於找到了個旗鼓相當的對手，約他一定要擇日再戰。亓凌霄則一副臭臉，對他理都不理。
第7集：太子夫婦間的信任危機2020年4月9日
熱布哈迪生出靈感，想讓妹妹把這個對頭纏住，自己來增加對蘭若溪的攻勢。但蘭若溪卻主動申請在醫館開堂授課，避免了和熱布哈迪獨處的機會。納蘭百川病情突然加重，王后也親自趕來探視，並下旨，若治不好則讓蘭若溪抵命。蘭若溪連番搶救，終於保住了納蘭百川的性命。亓凌霄看著疲憊不堪的蘭若溪，十分心疼，便將怨氣都撒到了納蘭百川的身上，沒想到蘭若溪竟忍不住懷疑是他暗中對納蘭百川動了手腳。兩人一時間陷入了冷戰。熱布哈迪再來找他們時，亓凌霄醋意大發，終於忍受不了冷戰的狀態，主動找到蘭若溪並向她表明心跡，蘭若溪也終於明白自己誤會了亓凌霄。兩人坦誠交流後，終於意識到是有人暗中作祟。
第8集：醫妃再添事業粉2020年4月16日
在蘭若溪守夜的某天夜裡，一個黑衣人進入醫館要行兇。危急時刻，亓凌霄及時救下了蘭若溪和納蘭百川。亓凌霄傷了黑衣人的左肩，但亓凌霄的人皮面具也被劃破。而此刻，半夏不小心耳聽目睹了“顧西風“的真實身份，在兩人苦勸之下，半夏終於答應幫他們二人保守秘密。當夜，密室中，受傷的神秘人向傾城彙報失敗的結果，傾城因為自己的執念讓神秘人受傷而深感自責，神秘人則安慰她，讓她想做什麼就做什麼，並表示自己會一直護著她。熱布哈迪一回朝便來找蘭若溪，得知醫館被襲後十分擔心，蘭若溪卻表示無礙，並主動請求去熱布哈迪的營帳看他帶回來的藥，以此來給亓凌霄和半夏時間去修復面具。
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第9集：撒糧虐醒單身汪2020年4月23日
熱布哈迪得知“顧西風”劃傷了刺客的左肩，便下令徹查但一無所獲。某天守夜，納蘭百川突然醒了，三人面面相覷。納蘭告知關於下毒一事，他有新線索。三人定下計策，準備對外說納蘭快要甦醒，引敵人上鉤。王后設家宴款待“顧西風”蘭若溪二人。亓凌霄借酒勁離開宴席。黑衣人撞上等待已久的亓凌霄，連忙逃走。因熱布哈迪的打擾，亓凌霄未能抓住黑衣人。蘭若溪撿到了黑衣人掉落的東西正是王后用的金絲手帕。亓凌霄和蘭若溪將對王后的懷疑告訴納蘭百川，納蘭百川大驚。蘭若溪自己潛進寢宮深處，悄悄地看了王后的左肩，卻發現並沒有傷口。片刻後，王后醒來，見到蘭若溪，眼中卻閃出了異光，蘭若溪頓時暈倒在地。
第10集：王后、公主誰是魔鬼？2020年4月30日
納蘭百川此刻深知再不公開自己已甦醒的訊息，正式對外公佈了自己甦醒的訊息，南炎舉國歡騰，除了密室中的傾城幾人。蘭若溪和亓凌霄因為治好了納蘭百川，被南炎上下視為大英雄大功臣，納蘭百川藉機看王后是否有易容痕跡，只可惜最後沒有發現絲毫痕跡。就在其樂融融時，突然有人來報，兵營中突現多人吐血昏迷的情況，症狀一模一樣，疑似瘟疫。蘭若溪三人前往兵營發現這些人是中毒，而且所中之毒與納蘭百川一模一樣。軍營中便抓到了疑似投毒者，王后親自過審，結果此人竟是東臨的探子。亓凌霄終於知道對手要用此舉來激化南炎與東臨的矛盾，而王后果然不顧納蘭百川和半夏的阻攔，正式下詔，與東臨宣戰。
第11集：憨直世子落淚惹人憐2020年5月7日
南炎舉行了盛大的祭神大典，被陣前偽裝成舞蹈的宮女的明月突然一記暗器射向熱布哈迪。蘭若溪本能地救下了熱布哈迪，結果自己卻受傷暈倒。而此時亓凌霄情急之下忘記掩飾自己的聲音，被明月認出並叫出了亓凌霄的名字，沒想到暴露了亓凌霄的身份。熱布哈迪此刻才知曉，眼前的“顧西風”竟然是東臨太子亓凌霄，立刻命令手下捉拿他和明月。納蘭百川主動做了明月的人質，亓凌霄帶著蘭若溪逃走，亓凌霄在半路被熱布哈迪帶人攔下，為了保護蘭若溪，亓凌霄不得不束手就擒。出城之後，明月回東臨，納蘭則決定先去一個地方調查真相。蘭若溪昏迷期間，熱布哈迪不眠不休地陪在她身旁。
第12集：太子被逼寫休書2020年2月21日
因蘭若溪傷勢較重必須要得到一味草藥方能救命，熱布哈迪就去找尋此藥，並在回來的路上從馬背上摔下。但他不顧自己的傷勢以最快速度趕回去救若溪。此時，亓凌霄在獄中被鐵鏈牢牢拴住。此時納蘭百川找到詭醫，想查明用什麼辦法可以控制一個人的神智。詭醫決定讓他試藥才告訴他。明月回到了東臨與亓凌雲逼迫“亓凌霄”說出實情，亓凌雲立刻召集兵馬，準備進攻南炎。熱布哈迪正在照顧蘭若溪時，手下來報，亓凌雲率兵襲來。熱布哈迪披掛上陣和亓凌雲打了一場，雙方不分勝負，各自收兵。回來後正好趕上蘭若溪甦醒。
第13集：大結局上 霸氣表白2020年2月21日
蘭若溪醒後熱布哈迪質問蘭若溪為什麼背叛南炎。蘭若溪乾脆把自己不是蘭若溪本人的事一股腦全說了出來，熱布哈迪卻不願相信，並表示要堂堂正正把她從亓凌霄手中搶回來。蘭若溪得知戰況，表示一定要去勸亓凌雲暫時休兵。蘭若溪臨行前，去天牢見了一次亓凌霄。亓凌霄為了保護蘭若溪，寫下了休書，熱布哈迪想以此來試探蘭若溪，但蘭若溪卻表示自己二人心意相通，互相理解。熱布哈迪感嘆自己終究還是落了下乘。蘭若溪來到東臨軍帳，聽從了蘭若溪的勸說，表示只要明天之前見到亓凌霄，就立刻退兵。熱布哈迪得知亓凌雲的條件後，也暫時休了戰。王后表示談判可以，但對戰爭的準備仍要進行。但卻暗中在寢殿宣佈召集影衛團入宮，讓兩方永無休戰的可能。
第14集：轉心術秘密 大結局中2020年2月21日
王后派出的影衛正要對亓凌霄動手，被青木等人救下。蘭若溪也及時趕到，幾人一同逃出大牢。王后卻親率人馬把他們都抓到了大殿中。熱布哈迪匆匆趕來，王后說他們妄圖劫獄，叛國通敵，罪無可恕，亓凌霄卻說王后想要除掉自己，使兩方永不休戰，其心可誅。關鍵時刻，納蘭百川終於趕到，揭開了真相。一切都是陸英操控。陸英終於忍無可忍，突然出手，混戰一觸即發。青木為了保護熱布哈迪，中刀身亡，熱布哈迪和亓凌霄聯手對抗陸英眾人，陸英不敵，便利用轉心術控制了蘭若溪，蘭若溪拿刀比著自己的喉嚨站起了身。亓凌霄等人不敢妄動，陸英帶上蘭若溪便趁機逃入南炎地下要塞五行陣，亓凌霄見到了潛藏在此處的影衛團現任主人，竟是傾城。
第15集：大結局下 願有來世2020年2月21日
陸英妄圖讓若溪生祭機關陣，熱布哈迪卻發現救蘭若溪只能自己換下蘭若溪。熱布哈迪讓亓凌霄帶蘭若溪逃走。陸英趁亂帶著傾城逃離了南炎，但身受重傷，命不久矣。傾城惶然無措，說陸英死後自己還有什麼理由活下去。陸英幫她消除了這幾年的痛苦記憶。傾城醒來時身邊空無一人。亓凌霄帶回蘭若溪，同時也帶回了熱布哈迪的死訊。蘭若溪和王后依舊昏迷，納蘭與亓凌霄聯手，手術成功，兩人都恢復如初。亓凌霄和蘭若溪回到東臨後，她再次做回了太子妃。而納蘭百川也繼承了南炎的王位，明月突然出現便在百官面前拐跑了納蘭百川。顧西風在封后大典結束後遇上了繼承了納蘭百川行醫夢想的半夏。半夏與他對視良久，笑道，好久不見。