麻醉風暴 第 2 季
2017-09-09 首播 · 共13集
在約旦擔任戰地醫生的蕭政勳（黃健瑋 飾），帶著創傷回台便遭遇捷運爆案。因緣際會，蕭政勳與已分手的楊惟愉（許瑋甯 飾），接下康聯醫院創傷小組的成立任務。沒想到爆炸案的背後牽涉龐大的利益關係，整個醫療體系都深陷其中……康聯醫院新生代醫生“熊崽”（李國毅 飾），白天他是醫術高超的外科醫師，晚上就變身饒舌歌手。中生代醫生蕭政勳不僅面對熊仔的質疑與挑戰，另一方面又需要面對年輕醫療記者Zoe（孟耿如 飾），對當年人球案、爆炸案的窮追不捨。在世代交替的衝撞、理解、合作中，他們終究得再次面對未解的兩難：是要成為體制的共犯？還是勇敢和整個世界對抗到最後？
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《麻醉風暴》第 2 季 分集劇情共 13 集
第1集2017年9月9日
故事發生在《麻醉風暴》之後五年。康聯醫院的胸腔外科醫師熊崽資歷不深就有精湛的技術，但他經常不按SOP作業，也不在乎科內總額和績效點數，讓奉命施行撙節政策的外科部主任謝騰豐和急診室主任王晨宇十分不滿。熊崽的藥學系學妹沈柔伊在畢業後成為《醒世代》雜誌社的記者，她企圖透過報導盡社會責任，卻屢遭杜總編以讀者不愛看為由駁回。 康聯之所以施行撙節政策，是為了不在一個月後的評鑑失利並被降為地區醫院，靠著身兼董事長和院長的叔叔兼養父朱權綱當上副院長的楊惟愉是政策的負責人，她對收養她的家庭感到格格不入，也因為身份特殊而遭院內醫師埋怨。不喜歡社交場合的她勉為其難地與朱院長一同出席由頂盛藥廠董事長歐莎莉率團開發的新藥上市發表會，還為了評鑑向試圖討好衛福部次長吳偉胤和立法委員萬大器，但吳次長委婉迴避；頂盛十多年前曾推出一款麻醉藥“德利康AM2”，一群被該藥副作用影響的受害者組成自救會在場外抗議頂勝的黑心行徑，雖然吳次長和萬大器接下陳情書，但參與抗議的流浪漢邱達一認為無人重視此議題，便在市中心捷運站以自殺炸彈死諫。 蕭政勳醫師在約旦的跨國前線醫療站擔任戰地醫師，他與當地醫師Basem在醫療站內搶救傷者時遭逢爆炸，爆炸殺死Basem和蕭政勳的忘年之交A-Li，哀慟的蕭政勳思念起在故鄉台灣的友人，他返台後與在捷運站附近表演的熊崽及準備採訪熊崽的柔伊遇上爆炸
第2集2017年9月9日
熊崽和蕭政勳在廢墟般的捷運站內為大量傷患急救，兩人因替下半身被壓住的傷患劉家倫做現場截肢手術而結識。為了收治傷患，離捷運站最近的康聯將輕傷病患移往外面，熊崽因此與病患發生齟齬。蕭政勳在康聯與楊惟愉久別重逢，兩人關係今非昔比。蕭政勳由於人手不足而被派往支援手術，他在過程中認為熊崽自作主張的心態大有問題。 康聯為了不被降級而設立創傷小組，請因為現場截肢手術而受矚的蕭政勳擔任主任，小組成員包括神經外科醫師彭伯恩、整型外科醫師楊婕娜、骨科醫師比號和急診科護理長林頤彩，沒被選入的熊崽心生不滿。另一方面，《醒世代》的記者將熊崽的言論斷章取義，剪接成沒有深度的新聞，由於新聞中包括柔伊拍攝的影片，熊崽便誤以為柔伊是專門偷拍的狗仔隊，進而和她絕交。
第3集2017年9月16日
劉家倫出現咳嗽和頭痛症狀，熊崽推斷是上腔靜脈症候群，想要照電腦斷層掃描（CT）驗證自己的想法，卻被骨科主任（劉明勳飾）以成本控管為由拒絕，但蕭政勳同意了這個想法，而CT的結果也讓熊崽更肯定自己的診斷，不過因為熊崽不是創傷小組的成員，沒有發言的立場。此時劉家倫突然出現呼吸窘迫且需要急救，印證熊崽的診斷正確。儘管手術結果順利，但熊崽在過程中和蕭政勳對血液的運用方式有分歧，且他在術前向家屬做了保證，在蕭政勳提點熊崽後，熊崽以為蕭政勳在貶低自己，柔伊提醒他會省錢的醫生不見得是為了賺錢，可能是想將資源留給更需要的人。在熊崽向蕭政勳致歉後，兩人冰釋前嫌，不過蕭政勳仍在評估熊崽的表現。 康聯的公關史珮宣希望柔伊能撰寫拉抬醫院形象的報導，併為她提供獨家採訪做為交換[。柔伊製作了一則拉抬熊崽形象的新聞，讓熊崽得以進入創傷小組，兩人也和好如初。柔伊向熊崽透露自己成為記者的理由，而熊崽則向她提起自己父親熊蔚成因為被當作醫療人球而死的遭遇。柔伊找到涉及人球案的陳顯榮醫師，陳顯榮表示自己亦不清楚真相，會在瞭解後介紹關鍵人葉建德給她，但當日晚上，陳顯榮就因車禍而重傷。同時，《醒世代》辦公室的傳真機收到一封威脅信。
第4集2017年9月16日
受傷的陳顯榮被送往康聯，他被驗出嗎啡反應，且不知為何呈現不該由車禍創傷造成的僵呆狀態，身為他過去的下屬，蕭政勳傾盡所能救治他。柔伊撿到陳顯榮遺落的公事包，在偷看裡面的檔案後認為車禍與AM2自救會有關，更認為這起車禍和的捷運爆炸是一連串恐怖攻擊。雖然柔伊和攝影記者阿永前去自救會採訪時因為說錯話被自救會成員阿和趕走，但也和自救會義工邱淳搭上線。 蕭政勳受創傷後壓力症候群困擾，不時會聽到槍聲或爆炸聲。而在他自約旦寄給楊惟愉的信中，表示他發現自己在死亡面前形同赤裸，並透露自己對楊惟愉的思念。 萬大器希望康聯能購置自己友人所販售的新裝置，楊惟愉想兼顧器材品質和節流，便重列了新的器材單，但朱院長坦白費用差額是用來通過評鑑的必要之惡。一位骨折傷患被骨科和外科互相推諉，熊崽違反原則將他收入創傷小組，因此遭蕭政勳指責。
第5集2017年9月23日
服刑期滿的葉建德出獄後被柔伊攔截，從她口中得知陳顯榮昏迷住院的訊息，並自她那裡取走陳顯榮的公事包。無處可歸的他投靠蕭政勳，並無意間進入蕭家的嬰兒房，蕭政勳制止他後，憶起自己與Basem一段提及楊惟愉曾有身孕的談話。 康聯的財務狀況每況愈下，萬大器建議朱院長在董事會內安插自己的人馬，並保證評鑑會因此通過。創傷小組成為評鑑的重點，在一次熊崽自作主張的判斷後，彭伯恩對熊崽的容忍到了極限，兩人有所爭執[89]。在楊惟愉派蕭政勳和熊崽溝通後，熊崽才逐漸融入小組。
第6集2017年9月23日
雖然熊崽逐漸地融入了小組，但他向家屬做術前保證的行為終於有了惡果，由他主刀的傷患在術後昏迷不醒，傷患家屬便在醫院外聚眾丟雞蛋抗議。事後柔伊勉勵他“只要盡力救人，被救活的人就不會忘記你”，而劉家倫出院時也對熊崽表達感謝。 頂盛生技中心落成典禮上發生爆炸，數十位傷患被送往康聯，創傷小組施救的其中一名傷患回天乏術，讓熊崽受到極大的打擊，他回想起自己先前做過的保證，體認到即使自己全力以赴仍無法決定他人生死。柔伊懷疑爆炸案的犯人是自救會成員，並推斷曾是AM2臨床研究員的陳顯榮因此成為報復物件。葉建德在陳顯榮的電腦中發現熊蔚成的驗屍報告，死因是AM2濃度過高。柔伊在整理這些資料時被杜總編以案件超過記者管轄範圍為由命令不得再查
第7集2017年10月7日
柔伊告訴葉建德自己的推理，而葉建德用蛋糕向阿永換來他拍攝的影片，再假冒記者和柔伊一起造訪AM2自救會。透過與邱淳的談話和影片，葉建德判斷策劃典禮爆炸案的兇手就是邱淳，他還建議蕭政勳將AM2加入陳顯榮的藥物反應檢驗專案，並讓陳顯榮轉院，避免被萬大器動手腳。 熊崽向有戰地行醫經驗的蕭政勳詢問傷患在手中死亡的經驗，蕭政勳建議他平靜面對。一名孕婦因車禍受傷被送入康聯，由創傷小組救治。吳次長率領衛福部官員進入康聯，他們見到熊崽等人未按SOP急救孕婦，認為有嚴重的疏失。面對孕婦的丈夫，熊崽不再如過去一樣給出保證，而在手術過程中，熊崽不斷地將孕婦和先前疏失的幻影聯想在一起，並體認到自己過去對林宏任的行為不當。在孕婦逝世後，楊惟愉憶起自己曾經流產的、與蕭政勳的孩子，認為自己不是好母親，但蕭政勳認為是自己離開所造成的，兩人破鏡重圓後決定重新開始。熊崽再次登台表演時只聽見心電圖發出心跳停止的聲音，失常的他和柔伊到河邊藉酒消愁並大罵醫療制度，更表示自己不想再當醫師，柔伊親吻了熊崽。
第8集2017年10月7日
十數年前，邱達一是不良藥物的檢驗員，他發現AM2有副作用後便和立委助理熊蔚成召開記者會，當時身為《華週刊》編輯的杜總編在製作專題報導後，雜誌社和印刷廠皆發生火災。杜總編向柔伊說明了這段過去以勸她收手，但柔伊堅持繼續追查。陳顯榮的驗血報告印證葉健德的推論，但他在轉院的過程中已被史佩萱安排的專車下手導致心律不整。葉建德的獄友HANK（陳以文飾）出獄後與葉建德重逢，協助葉建德追查萬大器的底細。邱淳將柔伊和葉建德約至自己的藏身處以安排專訪，希望萬大器的惡行能被報導。他表示萬大器試圖將陳顯榮滅口，更施壓媒體讓父親邱達一的主張不受重視，進而使父親死諫，而自己是為報復他才設下炸彈。 蕭政勳先前在約旦遭遇的爆炸使他的腦內形成血腫塊，血腫逐漸擴大並影響到工作，讓他回想起自己與楊惟愉的相處過程，以及兩人要一起買露營車到蘇美島義診的約定。熊崽認為自己的醫術遠遠不足，便回康聯收拾行囊，在與比號談話得到啟發後，他重新振作並回創傷小組繼續救人。
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第9集2017年10月14日
杜總編向柔伊透露自己被雜誌社封殺的過去，並將自己珍藏的筆傳承給柔伊，允許她繼續追查頂盛。葉建德發現萬大器和史佩萱在飯店秘密往來，柔伊接到通知後前來偷拍，而邱淳也埋伏在飯店停車場伺機殺害萬大器。在萬大器和史佩萱翻雲覆雨後，兩人和朱院長、吳次長一同前往飯店餐廳。朱院長試圖詢問吳次長關於突擊檢查的事，但不領情的次長中途離席。 葉建德以《約翰福音》第八章勸戒邱淳不要犯罪，但邱淳不聽勸阻，挾持萬大器並企圖引爆炸彈，他的行動失敗，和在旁的柔伊一起被立委助理毆打，該段內容被阿永的相機拍下。邱淳留下遺言希望柔伊揭穿真相，隨後便引爆炸彈自殺身亡，柔伊受到爆炸波及，被送往康聯由熊崽救治。葉建德對無法阻止邱淳自殺感到不甘心，他在整理邱淳的遺物後得知邱達一投身抗議後屢遭恐嚇的經歷，也發現邱淳相當崇拜自己。
第10集2017年10月14日
柔伊清醒後，熊崽與她談話並找回自己行醫的初衷。萬大器派助理警告柔伊不得聲張，但堅持追查的柔伊帶傷暗自離院，帶走邱淳藏身處的資料，熊崽為了保護她，便將她安置在自己的家。康聯醫院沒有通過評鑑，被降級為地區醫院並面對裁員減薪的困境，朱院長和萬大器翻臉，萬大器安插的董事便召開臨時董事會改選董事長，達到目的的史佩萱隨即辭職。葉建德找上身兼康聯董事的仁新總裁尹德威，希望他動用人脈讓朱權綱續任康聯的董事長。葉建德把計劃告訴朱權綱，並認為改選董事會的關鍵人是社員代表外科部主任謝騰豐。 蕭政勳的病情日益嚴重，從彭伯恩口中得知蕭政勳病情的楊惟愉無法諒解蕭政勳隱瞞病情的行為，並希望兩人儘快結婚，兩人不久後便登記結婚。蕭政勳將自己的病情透露給葉建德，並要他在自己逝世後將一封信轉交給楊惟愉。不久後，蕭政勳腦內的腫塊壓迫到腦幹，致使他在醫院內昏倒，在他將自己的手錶交給楊惟愉後，隨即被送進開刀房進行開顱手術。
第11集2017年10月21日
蕭政勳在進行開顱手術後仍未好轉，不久後便與世長辭。熊仔替蕭政勳收拾遺物，看到Basem眼鏡臂上的話：“園丁的工作是照顧生命，而不是控制”。 萬大器以偽造的單據威脅朱權綱，讓他決定放棄董事長和院長的位置以保護女兒，這讓承諾了尹德威的葉建德的立場變得尷尬。萬大器下令撤除創傷小組，並安插史佩萱擔任董事長特助，讓她管理醫院賬目。邱淳藏身處的資料中有他的遺書及他偷拍到的影片，內容提到萬大器造成熊蔚成死亡、陳顯榮車禍、邱達一被誣陷、AM2強行上市。熊崽讀畢遺書後猶豫自己是否該殺萬大器復仇，柔伊則取得偷拍影片做為證據。
第12集2017年10月21日
HANK入侵史佩萱的電子郵箱，找到異常的資金流動資料，將該資料與楊惟愉交給葉建德的資料交叉比對，發現萬大器透過康聯洗錢；雖然阿永的相機拍到萬大器教唆助理毆打邱淳的影片，但相機記憶卡被為了錢而聽從萬大器指示的阿和搶走，葉建德出面取回記憶卡後，將之做為證據並寄給升任部長的吳偉胤；陳顯榮的行車記錄器則拍到萬大器的助理在車內動手腳的過程。 這些證據被《醒世代》公開後，萬大器找吳部長求援，吳部長表面上協助他，但實際上是棄卒保車。柔伊的行動讓熊崽的住處被搗亂，熊崽打算到醫院找萬大器理論，但他在進醫院前見到萬大器從醫院高處墜下重傷，而萬大器教唆助理打人的影片也經由衛福部曝光，暗示吳偉胤想將罪都推給萬大器。儘管面臨拯救自己仇人的掙扎，熊崽仍盡力救治萬大器。受到地檢署郭檢察官施壓，杜總編決定中止《醒世代》的報導，但柔伊在熊崽的住處裡發現熊蔚成的檢驗報告，且是有簽名和官印的正本，她認為這份報告足以做為直接證據，讓杜總編決定放手一搏。
第13集2017年10月28日
萬大器大難不死，經葉建德的勸告，他向大眾吐實以彌補過錯。在頂盛藥廠得速寧上市發表會上，HANK入侵記者會的電腦，播放萬大器指控吳部長的影片，而柔伊也拿出檢驗報告正本，指控歐莎莉掩蓋真相讓AM2上市，吳部長立即遭郭檢帶回地檢署偵訊，但案件卻因罪證不足而不起訴，讓葉建德決定採取法律以外的手段處理。HANK竄改部長的行事曆，讓柔伊藉著專訪部長的機會在他的辦公室內安放針孔攝影機。康聯的大幅改革逼得許多醫護人員辭職，也讓比號等醫師十分不滿，康聯決定罷工並舉辦血汗醫護權益抗爭演唱會引起大眾注意，並在各大入口網站直播。在演唱會上，熊仔演唱了為蕭政勳和夥伴們寫的歌，歌曲與針孔攝影機所拍到的、吳部長透露檢調內也有自己人的事一同播出，而清醒的陳顯榮也透露事件真相，令吳部長再次遭檢方調查。 葉建德將蕭政勳的遺書交給楊惟愉，裡面傾訴著蕭政勳對她的愛意[29]。為了取回董事長之位，王晨宇提議董事長改選並提名楊惟愉，由於謝騰豐關鍵的一票，楊惟愉成為康聯新任董事長，而謝騰豐則被任命為院長。在風暴告一段落後，楊惟愉和養父母的關係有所改善、葉建德和HANK有了新的落腳處、創傷小組的業務仍持續進行、而柔伊認為一切尚未結束，改變即將開始。