分集 共40集
《飛天小女警》第 1 季 分集劇情共 24 集
第1集：魔人出擊1998年11月18日
魔人啾啾從美術館偷走具有魔力的狗頭，並且企圖把全世界的人都變成狗，任由他的使喚。飛天小女警在變成狗後，奮力抓住了魔人啾啾，救了全市的人。
第2集：媽咪怕怕1998年11月18日
教授在市場遇到大美女而一見鍾情，卻沒想到大美女是瑟杜莎裝扮的，他的目的是要對付小女警，好讓他去偷市長的珠寶。最後小女警還是識破了瑟杜莎的陰謀，並將他逮捕。
第3集：蟑螂大軍1998年11月25日
蟑螂教練以為飛天小女警害怕蟑螂, 所以動員了大軍妄圖佔領地球，可沒想到害怕蟑螂的小女警們最終還是打敗了他。
第4集：雙胞案1998年11月25日
三個惡劣的歹徒在屢次行搶都被飛天小女警破壞以後，決定冒充飛天小女警作案。被冤枉的飛天小女警只好越獄，將犯人的真實面目揭開。
第5集：章魚怪物1998年12月2日
邪惡的“他”利用善良的泡泡離間毛毛跟花花的感情，泡泡發現真相以後想獨自對付他。最後，毛毛與花花和好，共同拯救了世界。
第6集：我要當壞蛋1998年12月2日
阿米巴幫一心想成為大壞蛋。為了被抓進監獄裡，他們故意違法，但卻總是以失敗告終。他們在無意中將新型感冒病毒傳染給全鎮，飛天小女警不得不把他們全都抓回來，好讓教授製作解毒劑。
第7集：毛毛髮威1998年12月9日
毛毛愛上了壞死幫派的老大王牌，想要跟他做朋友。王牌利用毛毛想要控制小鎮村，並且想要殺了花花和泡泡，還好毛毛及時發現真相，挽回一切。
第8集：大鬧小鎮村1998年12月9日
毛茸怪獸是個不喜歡別人碰他東西的傢伙。為了追逐入侵他家中的松鼠，把小鎮村搞得一團雜亂。最後，飛天小女警追到他家，把他逮捕後送進監獄。
展開其餘 16 集劇情 ▾
第9集：大戰鬼怪1998年12月16日
在布基怪人的領導下，只會在黑夜出現的怪物們，把太陽遮住，企圖將地球變成黑暗世界。最後，小女警們讓太陽重新閃亮，救了大家。
第10集：殭屍魔術師1998年12月16日
慘死在釘床上的魔術師變成了殭屍，準備向大家報仇。害怕殭屍的小女警們，為了保護大家的安全，只好去找殭屍。原本以為小女警們敵不過殭屍魔術師，沒想到最後他們還是救了大家。
第11集：電話惡作劇1998年12月23日
壞死幫派開始利用電話製作惡作劇。飛天小女警疲於奔命，結果他們發現每次都被騙。 毛茸怪獸、魔人啾啾、"他"，最後都跑到市長辦公室，教訓那些打電話搞惡作劇的壞死幫派。
第12集：無情的愛1998年12月23日
邪惡的“他”將小鎮村所有居民對小女警的愛，變成可怕的憎恨，妄圖借居民的手除掉小女警。不過，小女警還是痛揍了所有的人，趕走了“他”。
第13集：勁敵1999年1月6日
小鎮村突然來了一個超人保護大家，小女警們不再受到重視。但沒想到這個超人是假的。於是，小女警們想了一個妙計，讓超人在大家面前承認他的罪行。
第14集：魔人啾啾的誕生1999年1月6日
魔人啾啾綁架了尤教授，小女警們去營救教授時發現了一個大秘密。魔人啾啾曾經是教授的助理，而且小女警的誕生都是由魔人啾啾造成的。
第15集：漿糊怪人1999年1月13日
在幼稚園裡，同學們都欺負愛吃糨糊的艾墨。艾墨在意外中變成糨糊怪人，要向大家進行報復。最後在毛毛的道歉下，艾墨才不再摧毀小鎮村。
第16集：冰雪風波1999年1月13日
在一個酷熱的日子裡，花花偶然發現她有冰凍的能力。正當她向大家展現的時候，花花因為沒抓到搶犯，便發誓不再使用此能力。沒想到突然出現了一顆大火球，在泡泡跟毛毛的要求下，花花利用超能力救了大家。
第17集：可怕的泡泡1999年1月20日
泡泡因為生氣大家把她當小孩子看，便發誓要變強。她一個人打敗了綁架她的魔人啾啾，讓她的姐妹們對她刮目相看。
第18集：慘不忍睹1999年1月20日
市長被魔人啾啾綁架走了，小女警們趕去救他，卻不停地笑。市長追問半天，小女警也不敢說。原來市長的衣服被魔人剝光了，光著身體呢。
第19集：貓咪大盜1999年1月27日
小女警們抓住了偷鑽石的壞蛋，並且救回一隻貓咪。沒想到這隻貓咪竟是真正的壞蛋。它不僅把尤教授催眠，還有更多邪惡的陰謀。
第20集：罷免毛絨怪獸1999年1月27日
毛茸怪獸無意間當上了市長，但是卻讓小女警們沒有機會去抓壞人。小女警們只好去把前任市長找回來，並用摔角的方式決定誰才是真正的市長。
第21集：受不了的淘氣1999年2月3日
飛天小女警的球飛進了魔人啾啾的家。小女警於是上門想要回自己的球。啾啾想趁此大好機會除掉小女警。沒想到啾啾竟然會受不了小女警特殊的索要方式，最後還是把球還給了他們。
第22集：無聲的世界1999年2月3日
小丑彩虹撞到運送漂白劑的的卡車, 被漂成了黑白色。他還使得全鎮的顏色都不見了，不僅如此，村民們還都變成了啞巴。最後，泡泡想了一個辦法，唱了一首關於愛的歌，讓所有的顏色又都回來了。
第23集：粗暴小子1999年4月7日
魔人啾啾因為打不過飛天小女警，便仿效小女警的製作過程，創造了粗暴小子。小女警打不過粗暴小子，幾乎想要放棄。但機智的小女警最後利用女孩子的溫柔，又再次大獲全勝。
第24集：機器小女警1999年5月27日
尤教授擔心小女警們在維護正義時會受傷，因而製造了機器小女警來幫助她們。沒想到在對付大魚怪的同時，機器女警把美麗的小鎮村也給毀了。