分集 共40集
《飛天小女警》第 3 季 分集劇情共 24 集
第1集：銀髮族之戰2000年7月28日
飛天小女警前去銀行逮捕犯人時，發現犯人竟然是銀髮族。花花堅持他們必須敬老尊賢，於是他們決定不能跟犯人打。最後市長告訴他們，正義隊長是唯一能阻止這三個棘手大盜的人。於是花花說服正義隊長出來對付大盜，最後所有的老人都被送進了醫院。
第2集：花花的頭髮2000年7月28日
毛毛跟泡泡幫花花梳頭髮的時候，把花花剪了一個愚蠢的怪頭。當他們出去對抗怪獸的時候，所有的人都在笑花花，連怪獸也不例外。花花看見自己的頭髮嚇得躲回家，泡泡跟毛毛不敵眼睛怪獸，最後還是靠花花的頭髮打敗了怪獸。
第3集：搬家記2000年8月18日
尤教授因為工作的關係，帶著小女警們離開小城村，來到一個大城市。小女警們為了繼續她們保衛市民的責任，於是去見市長。無意中聽見銀行被搶，小女警們為了證明他們的能力，展開追捕歹徒的行動，沒想到毀了重要的橋梁，遭到市長禁止她們使用超能力。受不了的小女警最後又跟尤教授搬回小鎮村去了。
第4集：可憐的保姆2000年8月18日
尤教授急著要去演講，於是請市長來當保姆照顧小女警。可是市長忙著玩電玩，便打電話到監獄去叫保姆，沒想到來當小女警保姆的人竟然是魔人啾啾。魔人本想命令小女警幫他佔領小鎮村，沒想到被小女警的頑皮弄得筋疲力竭，最後甘願回到監牢裡去。
第5集：變身，變變變2000年9月8日
尤教授在實驗中想把蘋果變成柳丁， 一不小心電源超載，使得射線籠罩整個小鎮村，結果大家都互換了身分。魔人啾啾利用老婆婆的身分四處犯案，飛天小女警費了一番功夫才知道是魔人啾啾。當他們與魔人大戰時，教授找出了正確的方法，讓大家又回到原來的身體裡。
第6集：泡泡近視了2000年9月15日
花花跟毛毛髮現泡泡不太對勁，於是請教授幫泡泡檢查，結果發現泡泡近視了。教授幫泡泡配了眼鏡，可是因為花花跟毛毛的嘲笑，泡泡怎樣都不肯戴上眼鏡。最後對抗螞蟻時, 戴上眼鏡的泡泡威力大增，擊退螞蟻，還因為毛毛的不小心而恢復了視力。
第7集：公主市長2000年9月15日
公主的爸爸將小鎮村買下來，讓公主當上市長。為了報復飛天小女警，公主制定法律規定犯罪合法，於是花花搶光了公主家裡的東西，騙公主將小鎮村還給市長。 一切又歸於平靜。
第8集：小倉鼠的報復2000年9月22日
每逢星期五，幼稚園裡的小朋友就要將小倉鼠帶回家。這次愛搗蛋的米奇自願帶倉鼠回家，沒想到他卻虐待小枝，結果小枝變成大倉鼠，米奇因而得到教訓。
展開其餘 16 集劇情 ▾
第9集：掉入陷阱2000年9月22日
飛天小女警協助警察打擊犯罪，沒想到懶惰的警察因而懷恨在心, 想要除掉小女警，小女警掉入他的陷阱時，剛好大批警力趕到救出了小女警。
第10集：小女警與怪獸2000年10月6日
獸攻擊小鎮村，但是堅持用戰略的花花，卻跟堅持用蠻力的毛毛吵個不停。不管她們怎麼攻擊就是無法傷害怪獸。受不了的泡泡，於是上前拜託怪獸離開，沒想到怪獸就這樣真的走了。
第11集：狗狗危機2000年10月6日
夜深人靜的小鎮村，所有的居民都熟睡了，沒想到此時的美術館卻失竊了, 竊賊竟是魔人啾啾，而且還是偷以前偷過的胡狼頭神像。 花花一行人趕到魔人啾啾的住處，魔人竟然開始跟他們解釋他計劃的缺點，聽完以後的小女警們把魔人狠狠地揍了一頓後，送進監獄裡。
第12集：烏龍盜寶記2000年10月20日
歹徒偷走鑽石，卻不小心被包裝在玉米片裡，偏偏又被尤教授買回家了。為了拿回鑽石，歹徒裝成廣告中的兔子，想從小女警手中騙回鑽石，最後還是被小女警識破，而關進了監牢。
第13集：超級爛英雄2000年10月20日
小女警三人迷戀漫畫書上的英雄人物，以為只要有了酷酷的打扮跟道具，就是更好的英雄。沒想到這三個小鎮村的新英雄，卻不及阻止攻擊小鎮村的怪獸，還被怪獸訓了一頓。最後三個人終於明白他們不需要道具，只要發揮本能就行，接著就把怪獸打得落花流水。
第14集：糖果惹的禍2000年11月10日
飛天小女警打敗怪獸後，市長請他們吃糖，沒想到他們因此愛上了糖果。為了可以吃到糖果，她們叫魔人啾啾出來作案，好讓她們打敗他後，去跟市長要糖果。後來小女警們發現自己的行為是不對的，於是向市長坦承一切，勇敢的認錯。
第15集：貓咪不見了2000年11月10日
市長為了感謝小女警的努力，特別制定小女警日。就在表揚的同時，出現了大怪獸。不管小女警們怎樣努力，就是無法趕走怪獸。她們後來發現， 原來怪獸是在找不見的貓咪。於是他們只好開始幫怪獸找貓咪，怪獸才開心地離去。
第16集：警長髮威2000年12月1日
市長因為清潔女工教訓他的一席話，決定不再依賴飛天小女警。於是他搭上了輕氣球，帶著他的拳擊手槍，開始打擊犯罪。沒想到市長太著迷了，竟然連累無辜的市民，大家嚇得開始逃跑。此時飛彈就要炸燬小鎮村，飛天小女警只好趕快出手阻止飛彈，沒想到還是被市長搞砸了。最後市長聽取小女警的建議，繼續坐在桌子後面，負責打電話呼叫飛天小女警。
第17集：我愛玩具2000年12月1日
小女警們一醒來就發現房間了堆滿了玩具，原本以為是尤教授買給他們的，沒想到竟然是尤教授夢遊的時候拿回來的。因為小女警們好喜歡玩具，就任由教授夢遊並且拿回他們想要的玩具。尤教授發現後，就聯合市長演了一齣戲。讓小女警們自己認錯，皆大歡喜。
第18集：神秘大盜2001年1月5日
銀行的金庫遭到搶劫，唯一知道密碼的經理卻什麼都不記得，還一直喊頭痛。接著發生幾起的搶案，被害人的頭上都留下一個記號。苦思好久的小女警終於知道是水蛭人犯下的案子，於是利用市長當餌，引誘水蛭人上門，一舉擒獲。
第19集：為平等而戰2001年1月5日
小女警接到市長的電話，前去逮捕搶銀行的犯人。沒想到這次遇上的卻是一個女搶犯致命女。致命女說服了小女警相信世上的男人都在利用女人，於是小女警放走了致命女，轉而開始仇視男生。基妮老師跟貝倫小姐發現小女警不太對勁，於是一起開導小女警。小女警終於明白她們這樣是不對的，而前去逮捕致命女。
第20集：教授出擊2001年2月9日
尤教授因為無法好好的跟飛天小女警共度快樂的假期，於是自己做了超人裝，加入飛天小女警，一起打擊犯罪。沒想到教授看到小女警出生入死的場面，決定要保護他們，於是處處干預小女警。小女警們決定要讓教授知難而退,於是聯合了魔人啾啾,兩人大打出手,教授的確是知難而退了,可是沒想到魔人啾啾也被打得落花流水了
第21集：都是牙齒惹的禍2001年2月9日
尤教授為了獎勵小女警們打掃家裡，給了她們一人一塊，希望她們學習一塊錢的價值。沒想到毛毛興奮地把泡泡的牙齒打掉了，又發現牙齒先子會拿錢來換牙齒。於是毛毛故意想打掉泡泡的牙齒，陷害不成又轉而對付鎮上的壞蛋，無緣無故打掉他們的牙。最後大家反擊，毛毛也付出了代價。
第22集：無敵軍團2001年2月9日
所有的罪犯來到小女警家門口，想要除掉飛天小女警。他們不小心發現，只要團結起來，小女警就不是他們的對手。自此無敵軍團橫行無阻。一直到尤教授教了小女警一個辦法，她們才能拆散無敵軍團，一舉將他們全部擒獲。
第23集：善良的泡泡2001年4月3日
泡泡總喜歡撿一些可憐的動物帶回家，教授實在受不了了，於是告誡大家再也不可以養動物。可是善良的泡泡實在忍不住，她撿了一隻鯨魚回家。花花跟毛毛幫她把鯨魚藏起來，可是還是被教授發現，不得已只好把鯨魚放回大海。泡泡還順便放光了動物園裡的動物……
第24集：超能力午餐2001年4月3日
壞死幫派又在做壞事。趕到現場的飛天小女警教訓了他們一頓。沒想到壞死幫派的份子竟然突然間有了超能力，而且還把小女警們打得落花流水。最後壞死幫派因為拉肚子結果也失去了超能力，飛天小女警終於大勝。