分集 共26集
《星艦奇航記：重返地球》第 6 季 分集劇情共 26 集
第1集：分道揚鑣 （2）1999年9月22日
分節號船員叛變，他們在蘭森的帶領下劫走了九之七，還破壞了航海家號的護盾系統，令航海家號暴露於外星生物的攻擊之下，幸好損失不大。珍妮薇怒不可遏，認為蘭森觸犯了她竭力維護的所有信仰，發誓要抓住這個兇手，並開始不惜一切代價追捕分節號。查克泰一邊努力穩住珍妮薇的情緒，另一邊試圖聯絡最初幫助分節號接觸神秘外星生物的安卡利人。另一邊，想方設法從九之七身上套取情報的蘭森開始對自己所做的一切感到悔恨，當他打算向航海家號投降自首時，卻遭遇了一場意料之外的兵諫。
第2集：生存直覺1999年9月29日
三名與九之七的過去有關聯的博格個體暗中登上航海家號，試圖訪問九之七的記憶，被九之七發現並攔下。船員們審問了這些博格個體，原來，在幾年前一次意外中，九之七和這三個個體被困於一顆星球上，雖然最後他們被集合體救回，但不知何故，那三名個體被連線成了一個子集，能夠相互感應對方的思維，他們恢復了人性，並達成共識，一起設法脫離集合體，尋找九之七，試圖從她身上搞清楚連線是如何形成的，以及如何解除。
第3集：死亡之舟1999年10月6日
貝拉娜的穿梭機遇到一場離子風暴後經歷了一次瀕死體驗：她發現自己和母親身於克林貢“死亡之舟”中，並正向克林貢的地獄漂去，就在她想弄清楚發生了什麼事的時候，醫生喚醒了她。但擺脫死亡的貝拉娜依然惴惴不安，因為根據克林貢傳說，她的母親將進入地獄為不信奉克林貢信條的自己抵罪，貝拉娜決定讓醫生重現瀕死體驗，去死亡之舟上救出母親。
第4集：間諜醫生1999年10月13日
醫生為自己的程式中加入做白日夢的功能，但外星人卻藉此入侵了他的程式，利用他收集情報並策劃一次襲擊。
第5集：虛擬情人1999年10月20日
湯姆·派里斯買下了一艘外星穿梭機，將其命名為“愛麗絲”，結果派里斯在檢查過程中被愛麗絲的程式控制，開始不務正業，整日沉迷於修理穿梭機。貝拉娜試圖查明事情真相卻險些被愛麗絲殺害，珍妮薇下令徹查事件，結果派里斯私自駕駛愛麗絲出逃，飛向了一個危險的天體：粒子噴泉。
第6集：謎團1999年11月3日
從一次外交任務返航的杜沃克被一名隱形的入侵者攻擊，並受到了神經上的損害，要救治他就必須找到武器原型。航海家號聯絡附近星球的大使尋求幫助，得知此事是一個極度封閉且妄想的種族所為。在一位專門研究該種族的外交人員幫助下，珍妮薇下令搜尋這群外星人。而為了讓杜沃克恢復正常，尼利克斯也絞盡腦汁去幫助他。
第7集：惡龍之齒1999年11月10日
航海家號發現了一處能夠加快航行速度的亞空間通道，但其持有者拒絕提供幫助，並攻擊航海家號。航海家號迫降在了一顆處於核冬天行星上，他們在那裡的地下意外發現了亞空間通道的建造者——一群戰爭遺民，他們自900年前戰敗後就一直處於低溫休眠狀態。
第8集：勇者無懼1999年11月17日
九之七幫助船員躲避了大規模亞空間能量的衝擊，而這些能量中卻包裹著一艘古老的地球飛船——戰神四號，這是一艘在2023年發射到火星的載人飛船，途中遭遇異象，連同指令長約翰·凱利一同失蹤。航海家號在遭遇故障後受損，崇拜凱利的查克泰主動請纓登陸戰神四號，但同行提供技術援助的九之七對此冷淡，認為戰神四號只是一艘過時的飛船，沒有任何實際意義。戰神四號的回收過程不如想像中的順利，德爾塔飛船嚴重受損，查克泰受重傷，九之七不得不前往戰神四號上回收可用於修理的零件，她發現戰神四號進入異象後約翰·凱利還活著，並且一直在作努力探索異象，同時尋找回家的路，影像日誌記錄下了這位英雄的最後時日：不餒的精神和不懈的努力，令九之七深感震撼。
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第9集：航海家號上的陰謀1999年11月24日
在對航海家號上的資料進行同化吸收後，九之七開始懷疑這艘船並非是因為意外而來到第四象限的，她找到查克泰，告訴他航海家號的遭遇可能是星際艦隊的陰謀，之後又聯絡珍妮薇，說馬奇游擊隊策劃了守護者的意外，令兩人互相猜忌對方，好讓九之七能夠達成自己的目的……
第10集：探尋計劃1999年12月1日
雷金納德·巴克利為了聯絡上航海家號的船員而模擬了飛船的全息程式，卻再次對全息人物上了癮。
第11集：避風港2000年1月12日
哈里·金與湯姆·派里斯在全息甲板創造了一處愛爾蘭的村落晴港，並通過了一個全天候開放協議，讓船員們隨時能進來歇腳，前來湊熱鬧的珍妮薇意外對其中一個角色一見鍾情。
第12集：轉眼之間2000年1月19日
航海家號被困在了一顆行星的軌道上，而時空上意外出現的差動讓航海家號上的幾秒鐘就相當於該行星上的幾年，航海家號見證了這個星球上文明的成長，而這顆星球上的人民也奉航海家號為神靈。最終，在一名試圖登陸的外星宇航員的幫助下，航海家號終於成功脫離軌道。
第13集：萬世巨星2000年1月26日
航海家號上來了一批極度封閉、自負的客人，他們的飛船因為航海家號的掃描而受損，船員們只能給他們提供援助，這些外星人一上船就吹鬍子瞪眼，吹毛求疵，對航海家號上的所有東西都看不上眼，醫生在給他們治療時，無意中哼起了《I've Been Working on the Railroad》的小調，立馬吸引了這批外星人的注意，原來他們的文明中只有科學而沒有藝術，因此覺得醫生的歌奇妙，他們邀請醫生去表演，結果默默無聞的醫生一下子變成了萬世巨星，一發不可收拾，他開始荒廢工作，甚至打算向珍妮薇遞交辭呈，留下來繼續表演。不過就在他打算離開航海家號的時候，這群木頭木腦的外星人作出了一件令他意想不到的事。
第14集：紀念碑2000年2月2日
查可泰、湯姆·派里斯、哈里·金與尼利克斯在完成一次外勤任務後開始經歷奇怪的幻覺，覺得自己身處於戰場之中，珍妮薇讓三個人坐在一起，試圖復原出幻覺中的場景，經過拼湊後，發現那是一段外星戰爭中的大屠殺的記憶，為了證實三人並沒有參與屠殺，珍妮薇下令駛向任務區域，結果航海家號半數船員眼前也浮現出了這段記憶……
第15集：極速格鬥2000年2月9日
九之七與杜沃克在登陸享受假期的時候被綁架，杜沃克重傷，為了幫助他治療，九之七不得不同意參加一場格鬥比賽。在比賽期間，一位已經被綁架並參與比賽19年的希羅吉恩人主動指導九之七格鬥技巧及制勝訣竅，兩人結下深厚友誼。但是在決賽來臨時，九之七驚訝的發現自己的對手正是那位希羅吉恩人，並且對方希望九之七在格鬥中結束自己的生命。
第16集：何處是我家2000年2月16日
德爾塔飛艇被一群博格兒童佔領，查可泰、金、派里斯與尼利克斯全部成了俘虜。
第17集：來世精靈2000年2月23日
在不間斷地運行了愛爾蘭村莊的全息程式後，程式出現了問題。村民能夠注意得到船員們對全息程式下達指令並作出修改，他們開始把航海家號的船員們當成了來世精靈，並打算將他們趕出晴港。
第18集：逝者已矣2000年3月1日
一名死去的船員重新出現，並聲稱自己是被一名收養她的外星人復活的。
第19集：陌生家園2000年3月8日
伊琪布的家人找到了，儘管很不願意，但船員們和伊琪布本人都不得不接受他必須離開航海家號，回到父母身邊的事實，其中反應最激烈的是九之七，她想方設法要讓伊琪布留下來，但似乎希望渺茫，但就在她打算接受現實的時候，梅薩提不經意間說出了伊琪布被同化時的一個細節，令九之七大感吃驚。
第20集：用心良苦2000年3月15日
三名效率低落的船員與珍妮薇一同去執行任務。
第21集：真假難辨2000年4月19日
航海家號不停遇到向他們索要賠償的人，珍妮薇經過調查發現，原來幾週之前尼利克斯和派里斯出外遣時遇到了兩個“修道士”，他們乘人不備，盜走了德爾塔飛艇上的資料庫，並化裝成珍妮薇和杜沃克的模樣，四處招搖撞騙，弄走了這個星域的大量資源，又氣又好笑的珍妮薇指使船員抓住這幫江湖騙子，恢復航海家號的名譽。
第22集：靈感女神2000年4月26日
駕駛德爾塔飛艇墜毀在一顆青銅文明星球上的朵芮斯因為衝擊而昏迷不醒，同行的哈里·金則乘坐逃生艙失蹤。一位劇作家發現了朵芮斯和德爾塔飛艇，他根據飛艇上的日誌記錄來創作劇本，並將朵芮斯視作靈感女神。朵芮斯一開始並不情願，但她得知作家正試圖通過戲劇表演勸說一位諸侯停止戰爭，便決定幫助他完成最終的結局。
第23集：憤怒復仇者2000年5月3日
一個很老但很強大的凱絲回到了航海家號上，企圖改變自己的過去。
第24集：生命線2000年5月10日
探路者計劃使用脈衝器與MIDAS陣列，讓航海家號每32天就能接受並回複數據流。
第25集：鬼影憧憧2000年5月17日
在航海家號穿過一片星雲時，星艦的主電源需要被關閉，這讓尼利克斯變得焦躁不已。
第26集：揭竿起義 （1）2000年5月24日
珍葳發現可以分裂博格的機會，九之七則造訪一處虛擬世界，當地的個體能夠短暫保留自己的個性。