分集 共25集
《星艦奇航記：重返地球》第 5 季 分集劇情共 25 集
第1集：黑夜1998年10月14日
航海家號在穿越一片佈滿θ射線的黑暗空域時丟失了能量。這一切都源於一個種族汙染了這個空域，而這個空域的生命受到了致命傷……
第2集：博格個體1998年10月21日
醫生的移動全息發射器在一次傳送過程中被損壞了，九之七拿走修理，卻不慎將博格奈米探針與發射器融合，創造了一名擁有29世紀科技的博格個體——小一。怎麼處理這個博格人成為了船員們頭疼的問題。最終珍妮薇決定坦誠對待小一，併成功讓他融入到了船員中去。博格人接受到小一無意中發出的訊號，他們覬覦29世紀的科技，企圖攔截航海家號，剛剛才明白友情的小一為了拯救朋友們，毅然犧牲自己的生命……
第3集：極度危險1998年10月28日
貝拉娜故意將自己置入非常危險的境地，與此同時，船員們也打算建造一艘新的穿梭機——德爾塔飛艇。船員們開著德爾塔飛艇去一個氣態巨行星搶救他們的探測器，以防被外星種族搶走……
第4集：血肉之軀1998年11月4日
查可泰等人發現了一群人類形態的8472種族。這群8472種族模擬了星際艦隊總部來訓練侵入地球。查克泰被他們扣留了。後來珍妮薇主動要求和好，解除了奈米探針武器。雙方保持了聯絡並交換了技術。
第5集：母女情深1998年11月11日
納奧米·懷德曼的母親在外勤任務中受傷，三個外遣隊員被埋在了岩石下，尼利克斯因此負責照看納奧米。納奧米是一個非常敏感的小孩，幾次差點發現其他船員為她隱瞞真相。後來納奧米明白了真相，她很傷心，尼利斯在全息甲板找到了她。後來救援隊挖開了岩石，把外遣隊員救了出來。
第6集：超越時間1998年11月18日
在未來的十五年後，查可泰與哈里·金試圖阻止航海家號在一顆冰原行星上墜毀。他們冒著被銀河級挑戰號擊中的危險，用一個博格器件給過去的九之七發送資訊，使航海家號退出量子滑流，免於受損。
第7集：無限沉淪1998年11月25日
九之七出現了類似多重人格的症狀，這些人格來自她曾經同化過的人。這源於一個感染病毒的用來聯絡博格個體的博格節點。船員癱瘓了這個節點。但是投放這種病毒的種族很不高興，認為航海家號使他們喪失了摧毀博格的機會。
第8集：仁心濟世1998年12月2日
船員們從一艘癱瘓的飛船中救出了一名受傷的外星生物，它卻把自己緊貼在了貝拉娜·朵芮絲身上。醫生創造了一個卡達西全息醫生來幫助他。但是這個卡達西人很殘忍，用活人做實驗，所以貝拉娜拒絕治療。後來外星生物被移除後，醫生刪除了卡達西醫生的程式。
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第9集：三十天1998年12月9日
湯姆·派里斯無視命令，執意干涉一顆水行星上的世界。
第10集：虛實以對1998年12月16日
在穿過德沃爾星域時，航海家號被例行檢查是否藏有心靈感應者。航海家號將一批心靈感應的難民和船員藏到了模式緩衝器裡，檢查過後再物質化。後來一個檢察員投靠了他們，幫助他們找到了一個蟲洞。難民乘坐穿梭機進入了蟲洞……
第11集：被隱藏的記憶1999年1月20日
醫生髮現自己的某些記憶被隱藏了。這些記憶是一年半前，有兩個人同時受傷，時間只夠治療一個人，醫生選擇先救他的朋友哈里金。事後醫生陷入了無限的苦惱中，艦長不得不下令刪除這些記憶。在醫生的強烈要求下，他恢復了這段回憶……
第12集：混沌新娘1999年1月27日
派里斯最近的全息甲板探險《質子船長曆險記》出現了難以預料的情節。一些來自五維的光子生物認為全息甲板上的情景是真的，船員們才是模擬。光子生物和故事人物混沌博士在全息甲板開戰，船員們幫助消滅了混沌博士。
第13集：引力1999年2月3日
杜沃克與派里斯迫降在位於異像中的一顆行星，那裡的時間相對於外面流逝極快。他們遇見了一名叫諾絲的女性。在亞空間馬上就要封閉時，航海家號成功傳送了他們出來。
第14集：天賜之福1999年2月10日
一個大型的空間有機體用心靈感應誘使航海家號駛入它的消化腔中。所有船員都認為這是通向地球的蟲洞，並且收到了來自“家鄉”的好訊息。只有九之七和小納奧米認為這不是真的。航海家號進去後，船員都昏過去了。後來九之七和另一艘陷入的飛船合作，使這個有機體感到“肚子疼”，將他們排出了消化道。
第15集：黑暗前線1999年2月17日
珍妮薇計劃從一艘受損的博格球體上盜取一個超曲速線圈，來減短回家的旅程。 計劃實施時，九之七重新加入了集合體。她來到了女王身邊工作，因為博格需要她這種獨一無二的特質。後來珍妮薇乘坐德爾塔飛船使用超曲速找到了這兒，救出了九之七。
第16集：愛的瘟疫1999年2月24日
航海家號幫助瓦羅族的一艘世代飛船修復曲速引擎，而金則與對方的一名船員陷入熱戀之中。瓦羅族飛船後來解體了，變成了一個個單獨的自由的子節點。
第17集：忘卻的過去1999年3月3日
在“一艘”航海家號上，朵芮絲與派里斯結婚了。而此時，星艦受到來自子空間輻射的威脅，所有的船員開始分解。
第18集：混亂空間1999年3月24日
查可泰為了通過幻象探索與外星人取得聯絡，而躺在了醫務室中。
第19集：智囊團1999年3月31日
航海家號被某種族的船艦追逐，而一個名叫智囊團的外星人團體願意向她提供幫助。但是一切都是由這個智囊團引起的。
第20集：核心勞工1999年4月26日
船員們回應了被輻射汙染的馬龍飛船逃生艙的求救呼號。
第21集：誰在守候我1999年4月28日
困於無法融入集體的九之七向“愛情教授”醫生“約會”以獲取幫助，學習如何融入人類集體，但在磕磕碰碰不斷的教學過程中，醫生居然發現自己朦朦朧朧地愛上了九之七，併為這段單相思而苦惱不已。另一邊，尼利克斯因為不小心讓外星大使醉酒而陷入外交上的麻煩。
第22集：11：591999年5月5日
珍妮薇在和尼利克斯閒聊歷史時回憶起她的一位祖先，來自印第安納的夏農·奧唐奈，她曾在千禧年除夕夜的最後一刻說服一位釘子戶——亨利·珍妮薇拆除自家書店，為世紀工程千禧門的建設鋪平道路。這次談話竟然激發了船上所有人探尋歷史的興趣。
第23集：相對時間1999年5月12日
聯邦時艦相對號的艦長布拉克斯頓把九之七送回過去，以阻止航海家號被破壞。
第24集：人工智慧1999年5月19日
船員們發現了一個嵌入石頭的人工智慧裝置，但隨後這個裝置卻奪取了醫生的控制權，原來這是一種大規模殺傷性武器。
第25集：分道揚鑣 （1）1999年5月26日
航海家號接收到來自同樣被困於德爾塔象限的分節號的求救訊號後，立刻趕往救援，他們發現分節號此刻正遭受某種不明生物的攻擊，損失慘重。航海家號及時將護盾延伸，保護了分節號。兩艘船的船員們相互介紹後立刻著手開始修復工作，但九之七發現了一些疑點，分節號船長蘭森似乎故意汙染船上的實驗室，阻止他人進入，他對船上系統的奇怪“改進”也沒有作出任何解釋。同樣感到困惑的珍妮薇派出醫生進入分節號實驗室，卻發現了一個驚人的事實：分節號船員正試圖屠殺外星生物，並從他們身上提取能夠加快航行速度的燃料。