寶可夢 第14季 超級願望 (合眾地區 上)
2010-09-23 首播 · 共48集
生活著眾多從未見過的新的寶可夢的新世界，踏上合眾地區的旅行。 熟悉的組合，小智和皮卡丘，如今兩人又發生了微妙的變化，新的關鍵詞是“速度感”和“新鮮感”。 在合眾地區旅行的小智，遇到新的寶可夢們及新的寶可夢訓練師們。以從未有過的速度展開寶可夢訓練師之間的對戰，新加入的夥伴們陸續登場，還有從不認輸的皮卡丘帶來的新的變化，寶可夢的終極進化！你從未見過的寶可夢新世界的冒險即將展開！
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《寶可夢》第14季 超級願望 (合眾地區 上) 分集劇情共 48 集
第1集：前往合眾地區！捷克羅姆的身影!!2010年9月23日
還沒有見過的寶可夢…還沒有見過的城鎮…。為了見到未知的事物，小智與皮卡丘到了全新的冒險之地──合眾地區！正為了在新天地的冒險雀躍不已時，眼前出現了這地方的寶可夢研究權威——紅豆杉博士！大家立刻前往研究所，在那中心，有像是黑色巨大寶可夢的影子。影子放出的雷電直接擊中小智的皮卡丘！兩頰不斷放電讓皮卡丘很難過。眾人急忙前往博士的研究所詳細檢查，但是結果卻出人意料…。皮卡丘竟然不能用電屬性絕招了！以混亂揭開序幕的旅程，到底會怎麼樣呢!?
第2集：艾莉絲與牙牙！2010年9月23日
雖然皮卡丘身上發生的異變令人困惑，小智他們仍決定要在合眾地區旅行。首先是為了收服這個地方的寶可夢而進入森林，然後就發現搖搖晃晃的草叢！急忙用圖鑑判別，結果顯示是"牙寶可夢"牙牙！小智馬上丟出精靈球要收服它！但是，精靈球擊中草叢後卻傳出人的聲音！？接著，衝出來的並不是牙牙，是個女孩子！她叫做艾莉絲，而目標牙牙躲在她的頭髮裡！究竟這名神秘少女的真實身分為何…！？
第3集：水水獺！黑眼鱷！危在旦夕！！2010年9月30日
小智首先以第一間道館的所在地三曜市為目標。接著，艾莉絲在路上遇到叫做阿丹的少年。他家好像在附近開設溫泉渡假旅館，有很自傲的沙浴。正當大家準備做沙浴的時候，周圍卻不斷冒出"沙漠鱷魚寶可夢"黑眼鱷！照阿丹的說法，它們平常非常溫順，會和訓練家一起享受沙浴。但是，這些黑眼鱷卻突然開始拼命的挖掘地面！無視於一旁驚訝的小智等人，它張開大嘴把皮卡丘與牙牙、以及偷偷跟來的水水獺帶走了！這隻黑眼鱷的目的到底是什麼!?
第4集：對戰俱樂部！神秘的寶可夢現身!!2010年10月7日
朝著三曜市持續旅行的小智一行人，在途中經過的城鎮發現有趣的設施。那是被稱為“寶可夢對戰俱樂部”、讓訓練家可以自由對戰的場所。幹勁十足的小智猛衝進對戰俱樂部！出來迎接的是俱樂部的經理東·喬治。一番對談後，他很快就讓帶著合眾地區很少見的皮卡丘的小智上場。然後，對戰開始！但是，正準備一口氣發動攻擊取得先機的時候，刺耳的警報聲大作！似乎是有什麼人侵入倉庫的樣子。調出攝影機拍到的影像進行確認後，在那裡的竟然是…！！
第5集：三曜道館！VS爆香猴、冷水猴、花椰猴!!2010年10月14日
終於到了三曜市！小智為了在合眾地區的第一場道館賽興奮不已，這時他面前出現一名叫做天桐的青年。天桐看到艾莉絲與牙牙相處融洽的樣子，判斷他們的適性很好。原來他具有“寶可夢酒侍”的資格，可以看出訓練家與寶可夢的適合度。因為難得遇到，於是一行人一邊聊一邊請他帶路到三曜道館。然後，眼前出現了期待已久的三曜道館！小智進入戰鬥模式衝了進去！但是，建築物當中卻是一片令人覺得走錯地方的景象…
第6集：夢的遺址！食夢夢和夢夢蝕！！2010年10月21日
結束道館賽，小智一行人來到寶可夢中心讓疲累的寶可夢復原。這時艾莉絲抱著牙牙急急忙忙衝進來！她懷中的牙牙發出淺淺的粉紅色光芒，沉沉昏睡。照她的說法，睡著的牙牙完全叫不起來！就在大家為這件事困惑的時候，一位帶著"食夢寶可夢"食夢夢的女性出現了！她叫做真菰，而且好像知道這種昏睡的原因。小智一行人為了解決這件事而衝出中心，卻看到驚人的景象！粉紅色光點從天而降，君莎小姐也發出緊急警告。城裡陷入恐慌…
第7集：藤藤蛇·迷人收服!?2010年10月28日
小智、艾莉絲、天桐，決定一起旅行的3個人在森林裡休息時，"草蛇寶可夢"藤藤蛇出現，擅自吃起天桐做的蛋糕！正當皮卡丘要使出十萬伏特時，卻莫名其妙地被愛心包圍，最終眼冒愛心！看來，似乎是中了藤藤蛇的“迷人”。擺出一副輕視模樣看皮卡丘的藤藤蛇，以敏捷的動作逃走。但是，因此燃起熊熊鬥志的小智，下定決心非收服它不可，於是開始緊追不捨。究竟小智慧不能成功的收服藤藤蛇呢!?
第8集：火紅不倒翁與達摩狒狒！鐘塔的秘密!!2010年11月4日
朝著下一個目的地前進的路途中，小智一行人與寶可夢在河邊吃午餐。正當大家和樂融融地用餐時，皮卡丘與牙牙的寶可夢食物不見了！正要找出是誰搞的鬼時，出現了2只"不倒翁寶可夢"火紅不倒翁！它們使出“噴射火焰”甩開追上去的小智等人，一轉眼就逃跑了。雖然想抓它們，不過治療受傷的寶可夢比較重要，所以大家趕往寶可夢中心。可是，2只火紅不倒翁居然出現在那裡，而且還再度搶走食物！到底火紅不倒翁的目的是什麼…！？
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第9集：蜈蚣王發飆！救出牙牙！！2010年11月11日
艾莉絲與牙牙、天桐與花椰猴，相對的兩組人馬正在練習對戰！但是，面對目前還力量不足的牙牙，花椰猴也降低了絕招的威力。艾莉絲告訴牙牙慢慢變強就好了。牙牙最喜歡總是溫柔照顧自己的艾莉絲，於是決定去森林裡找樹果送她。然後，發現某棵高聳的樹上有似乎很美味的樹果！牙牙不理會急忙跑來阻止的皮卡丘，爬上了尖細的樹枝要摘樹果。就在只差一點點的時候，樹枝折斷讓它倒頭摔了下來！還落在"巨大蜈蚣寶可夢"蜈蚣王身上！受驚的蜈蚣王於是拖著牙牙開始橫衝亂撞…！
第10集：勁敵對戰！強敵輕飄飄！！2010年11月18日
以七寶道館為目標，繼續旅行的小智一行人，在路過的城鎮發現寶可夢對戰俱樂部！小智馬上就跑去找對戰對手。結果竟然發現修帝的資料！他立刻提出對戰要求，請東·喬治先生用即時通訊器聯絡修帝。為了意料外的再戰熱血沸騰的小智，與一如以往冷淡登場的修帝，展開5對5的對戰！小智派的第一隻是水水獺、修帝則選擇了"野鴿寶可夢"咕咕鴿。小智與水水獺利用扇貝貝進行獨創的攻擊！可是，修帝的咕咕鴿也不遑多讓的使出絕招！這場比試，誰會勝利！？
第11集：石居蟹！去奪回自己的房子吧！！2010年12月2日
持續朝著七寶市旅行的小智一行人，在路途中遇見在切割岩石打造住居的「石居神奇寶貝」石居蟹。在他們觀察著這珍貴景象時，又新冒出了三隻石居蟹！其中一隻頂著特別大的石塊，就像是當中的老大一樣。這個老大看重的，就是石居蟹努力打造出來的家！下一刻，這 3 只竟然一起攻擊石居蟹，奪走了它的石頭住家！目睹這種卑劣舉動的小智一行人，主動表示要幫石居蟹把家搶回來。石居蟹一開始還是很警戒，不過後來漸漸打開了心扉，接著作戰行動終於展開！到底會有何結果呢！？
第12集：破破袋戰隊與秘密基地！？2010年12月9日
在旅途中經過的某條路上，眼前出現了騎著三輪車的孩子們……接著，孩子們突然往這邊投泥丸子！這些孩子興高采烈地從遭到直擊的小智一行人身邊通過。而且，在這個軍團中的「垃圾袋神奇寶貝」破破袋還把小智的寶貝帽子撿走了！小智等人急忙要追上去時，一位叫做由梨的女性叫住他們。原來，由梨是剛才那些孩子的幼稚園老師，現在遇上了很大的困擾。大家為了弄清楚來龍去脈而前往幼稚園，卻被眼前的景象嚇了一跳！幼稚園竟然被垃圾山圍起來，建了一座秘密基地，而且孩子們還守在裡面不肯出來！
第13集：泡沫栗鼠有潔癖！？2010年12月16日
小智一行人朝著七寶道館繼續旅行。途中突然冒出一名少女撞向他們！原來她叫白露，是紅豆杉博士拜託她來轉交東西給小智的。而轉交的物品則是徽章收集盒！但是，被收在包包底層的盒子沾滿灰塵、髒兮兮的。不過，拿到重要收集盒的小智還是很高興。可是他高高舉起的徽章收集盒突然從手中消失了！同時，有一隻「栗鼠神奇寶貝」泡沫栗鼠跑走！它口中就咬著重要的徽章收集盒！小智他們立刻慌張地追上去。兵荒馬亂的追逐戰，到底會怎麼樣呢！？
第14集：七寶市！博物館大冒險！！2010年12月23日
終於抵達七寶市的小智一行人，目標當然是在七寶道館獲勝、得到第二個徽章！大家與幹勁十足的小智一起前往七寶道館！可是，位於博物館的七寶道館門戶緊閉，而且看來不太對勁……正當小智準備進行確認、伸手要開門探看的時候，從一名男性發出慘叫、從長廊另一頭跑來！這名驚慌失措的男性叫做木立，是博物館的副館長，而他似乎被捲入了大麻煩。仔細詢問木立之後才知道，這座博物館似乎有如妖怪作祟，連續發生了奇妙的現象……
第15集：七寶道館賽！VS 道館訓練家．蘆蕙！2011年1月6日
解決博物館奇妙謎團的小智一行人，見到了道館訓練家蘆蕙，終於要開始期待已久的道館賽！不過，要前往對戰場地，好像得要回答蘆蕙出的任務才行。雖然對意外的發展感到困惑，大家還是驚險過關！總算抵達對戰場地。使用一般系神奇寶貝的蘆蕙，高聲宣告要派出步哨鼠與小約克。向對手展現自己的陣容來觀察反應，似乎是七寶道館的風格。小智也緊握自己選好的 2 顆神奇寶貝球，接著，對戰賽開始！蘆蕙最初派出的「小狗神奇寶貝」小約克！小智則是派出暖暖豬。可是這場對戰賽，竟然出現難以置信的發展！
第16集：再次挑戰七寶道館！新絕招爆發！！2011年1月13日
賭上第 2 個徽章，與蘆蕙進行的道館賽。可是小智卻因為「吼叫」與「黑色眼光」這組聯合招式而敗下陣來。一心雪恥的小智，到對戰俱樂部接受東‧喬治的特訓。當然，暖暖豬與水水獺也一起受訓！小智首先與暖暖豬一起，為了對付蘆蕙的小約克那招強力「影子球」，進行閃躲球的特訓，接著是與水水獺一起下泳池，做逆流而上的特訓。他與學會新絕招的2只神奇寶貝，再度前往七寶道館！可是，對手是身經百戰的道館訓練家。對戰賽出現意外的發展……
第17集：蛋中孵出的小霸王！2011年1月20日
之前幫助幼稚園老師由梨時得到的神奇寶貝蛋出現變化！大家對它一邊不斷搖晃又一邊發光的樣子興味盎然。尤其是牙牙，大概是很高興增加新同伴，特別熱心地一直觀察。就在閃爍速度變快，看來終於要孵化的時候，開心得手舞足蹈的牙牙竟然撞到了蛋！而蛋就以飛快的速度滾下斜坡！小智等人急忙追上去，可是不斷加速的蛋被石頭彈起，飛向空中了！這樣直接砸到地面的話蛋會破掉的！突然發生重大危機！到底會有什麼結果呢！？
第18集：矢車森林！蟲寶包與亞堤！！2011年1月27日
繼續踏上旅程，前往下一間道館所在地飛雲市的小智一行人，在矢車森林遇到一隻「裁縫神奇寶貝」蟲寶包。為了收服好強不認輸的蟲寶包，小智熱血沸騰地直接往森林深處衝！結果，大家在像迷宮一樣的森林裡迷路了！3人努力想要回到進森林的路，於是爬上高聳大樹找路。可是，小智沒有找到路，卻找到了吊在樹枝上的巨大樹葉堆！下一個瞬間，樹葉散開，飛雲道館的道館訓練家‧亞堤竟然颯爽現身！大家一邊談話一邊走入森林，就看到剛才見過的蟲寶包……
第19集：酒侍對決！石居蟹 VS 雙刃丸！！2011年2月17日
在前往飛雲道館的路上，躍入小智一行人眼簾中的，是新開幕的友好商店！興奮期待的往裡面一看，可以看到最裡面出現排隊人潮。看樣子，似乎是公認神奇寶貝酒侍，在那裡品評訓練家與神奇寶貝的樣子！很感興趣的小智一跑進去，就遇到一個女孩子。她的名字叫赤霞珠，據說確實具有公認的酒侍資格。小智讓她看自己最自豪的神奇寶貝。可是下一個瞬間，眯起眼睛、對著神奇寶貝圖鑑開口的赤霞珠，說出令人不敢置信的話……
第20集：皮卡丘對黑眼鱷對鴨寶寶！！2011年2月24日
小智與皮卡丘目前陪著從蛋裡孵出來的滑頭小子進行特訓。就在打算休息一下吃午餐的時候，他們掉進隧道狀的洞穴裡了！在抵達地點等著他們的，是以前見過的戴墨鏡黑眼鱷！它似乎是為了挑戰皮卡丘要求對戰，才會挖洞找大家來的。面對鬥志高昂的黑眼鱷，小智與皮卡丘決定答應對戰。可是，這時冒出一隻「水鳥神奇寶貝」鴨寶寶，搶走了黑眼鱷的墨鏡！其實這隻鴨寶寶超愛惡作劇，它接二連三地做出讓小智他們感到困擾的惡作劇，但是……
第21集：天之箭橋與哥德小姐！2011年3月3日
小智一行人抵達通往飛雲市的大橋「天之箭橋」，但是橋上卻起了霧、讓人看不清楚。無論如何都要趕著過橋的小智他們，毫不在意的開始過橋。這時候，「天體神奇寶貝」哥德小姐從霧中現身，出手攻擊他們！不得以之下，小智派出藤藤蛇應戰，四周卻突然被光線包圍，回神過來就發現大夥又回到橋下了。可是，周圍看起來卻不太對勁……在小智等人正感到不安的時候，一個叫莎麗的少女向他們打招呼！而帶著笑容跟在她身邊的，正是襲擊小智他們的哥德小姐！
第22集：飛雲市！百足蜈蚣恐慌！！2011年3月10日
總算抵達飛雲市了。當地不愧是被稱為合眾地方中心的城市，四處都是高聳的建築大廈。小智的目的當然是與亞堤進行道館賽……可是，在街上與一行人偶遇的亞堤卻說，現在有很掛心的事情，沒心思進行道館賽。問題就在，城裡的蟲系神奇寶貝們出現奇怪的反應。為了查明原因，小智他們展開共同行動，最後追到了地下水道。就在那裡，出現了一隻「蜈蚣神奇寶貝」百足蜈蚣。而且，它就像亞堤說的一樣，情緒躁動又顯出強烈的敵意。而這個變異，隱藏著令人恐懼的事實！！
第23集：飛雲道館賽！純情之心的蟲屬性寶可夢對戰!!2011年3月17日
小光漂亮的晉級到第二次審查，接下來終於要進行華麗對戰賽！小光與神奇寶貝們都氣勢十足。這次是要以象牙豬、帕奇利茲搭檔配合，不斷特訓的「冰燦水晶燈」一決勝負。阻擋在小光面前的對手，是在第一次審查演出至今無人見過的強烈表演的烏拉拉！在興奮狂熱的會場，對戰開始！首先發動攻勢的，是順著高昂氣勢出手的烏拉拉。尖牙陸鯊與火精靈的組合招式爆發威力！相對於隨後一口氣趁勝追擊的烏拉拉，小光他們一直難以抓到機會扭轉情勢。要讓這種狀況逆轉，只能以大絕招放手一搏……究竟這場對戰，會由誰獲勝！？
第24集：要小心可愛臉蛋 被導電飛鼠電到發麻2011年3月24日
在與白露同行前往雷文市的途中，「飛鼠神奇寶貝」導電飛鼠出現在小智一行人面前！導電飛鼠幫牙牙撿回樹果的可愛模樣，把神奇寶貝們都迷倒了。那可愛的模樣讓白露興奮不已，馬上決定要進行對戰收服它！可是，導電飛鼠在對戰中使用迷人讓對手無法戰鬥，直接逃走了。白露急急忙忙追上去，但是牙牙不知道為什麼也一起追過去了。它似乎是想要向幫了自己的導電飛鼠回禮。可是這隻導電飛鼠有著令人意想不到的秘密……
第25集：導電飛鼠 VS 藤藤蛇 交換伏特大混亂2011年3月31日
艾莉絲才剛收服導電飛鼠，就馬上開始進行對戰特訓。可是，一開始和白露的泡沫栗鼠對戰，導電飛鼠就在沒有指示的狀況下使出「交換伏特」，和其他神奇寶貝交換！而且，它的交換伏特有點奇特，就連小智和天桐的神奇寶貝都被拉出來交換！躲在樹上高高興興看大家慌成一團的導電飛鼠，似乎很愛惡作劇的樣子。它使用迷人使喚異性神奇寶貝，又裝哭讓大家向它道歉，為所欲為！但是，有隻以銳利眼神觀察這一切的神奇寶貝……
第26集：燭光靈大宅的恐～怖故事！2011年4月7日
以雷文市為目的地，持續旅行的小智一行人，因為突然下起大雨而四處找地方躲雨。接著小智他們總算找到一棟在山丘上的洋房，決定進去休息一下。但是這時候，書架和花瓶自己動了起來，開始攻擊小智一行人！大家一邊逃命，一邊靠皮卡丘的十萬伏特勉強甩開攻擊。其實這是「蠟燭神奇寶貝」燭光靈搞的鬼！發現這點的小智等人，追問燭光靈這麼做的原因。而透過螢幕監視他們的人影是……這座宅第隱藏的恐怖秘密即將真相大白！
第27集：通往龍之大師之道！牙牙對赤面龍！！2011年4月14日
在牙牙與滑頭小子進行對戰特訓時，森林中傳來神奇寶貝的吼叫聲。那聲音是「洞穴神奇寶貝」赤面龍發出來的！它還突然使出集氣彈攻擊，讓小智一行人急忙閃避。這時候，有位追著赤面龍而來的訓練家。名叫艾咪的少女是赤面龍的訓練家，她似乎是跟丟了突然開始大鬧的赤面龍。對龍系神奇寶貝特別有興趣的艾莉絲靠近一看，發現赤面龍的腳上纏了粗重的鋼索。看來它是因為這樣才開始大鬧的。看到艾莉絲的應對方式，艾咪拜託她教導自己龍系神奇寶貝的養育方法……
第28集：消失的扇貝貝！水水獺最大的危機！！2011年4月21日
朝雷文市繼續旅行的小智一行人，遇上帶著「帶電神奇寶貝」斑斑馬的訓練家‧甘尼洋要求對戰！自願在這場對戰中出場的，竟然是水系的水水獺！它幹勁十足，打算用自傲的扇貝貝把任何攻擊都打回去。水水獺在對戰剛開始的時候華麗的閃躲過電系絕招，但是在被斑斑馬威力強大的「連環腿」擊中時，重要的扇貝貝被打飛到很遠的地方去！水水獺與小智急忙跑去尋找，可是到處都找不到扇貝貝。失去最大的武器，讓水水獺啞然失色。為了鼓勵水水獺，小智等人開始尋找可以代替扇貝貝的東西，可是……
第29集：戀愛中的木棉球乘風飛翔！2011年4月28日
小智他們像往常一樣進行特訓，結果有一隻「棉球神奇寶貝」木棉球跑了出來。照天桐的說法，這個時期木棉球會集體行動，然後成雙成對的踏上旅程。這隻木棉球似乎是和團體走散了。可是他這樣是有理由的。滑頭小子在草叢的對面發現另一隻木棉球！看來最初遇到的木棉球，是因為喜歡上這一隻才追過來的。要得到芳心就得展現自己的堅強實力，這是木棉球的規矩。可是，最初遇到的那隻木棉球在對戰中被輕鬆打敗了。看到它後悔不甘的樣子，小智一行人決定幫忙進行對戰特訓……
第30集：小灰怪與不明飛行物體！2011年5月5日
為了準備應付前往雷文市的漫長旅程，小智一行人沉沉睡去休養生息時，突然有發出驚人光芒的神秘飛行物體飛過，那行動看來就像幽浮一樣……天亮之後，小智他們馬上四處打聽有關神秘飛行物體的情報，得知有位井守博士住在郊外的研究所。為了向他請教，大夥決定前往研究所，可是，到了門口的3人卻遇上不可思議的現象！腦中突然浮現從來沒有看過的影像！突然發生的事情讓大家感到不安，而且，有個在暗處觀察這狀況的身影。那是手上光點會不規則閃爍的「腦神奇寶貝」小灰怪……
第31集：勁敵對戰！迷你冰、搬運小匠參戰！2011年5月12日
小智一行人繼續旅行，在準備吃午餐的時候，意外遇到了帶著「新雪神奇寶貝」迷你冰，打算進行對戰收服藍蟾蜍的修帝！但是，小智打亂狀況，讓藍蟾蜍跑掉了。在修帝打算離開的時候，小智要求進行對戰。原本要拒絕的修帝，因為被艾莉絲笑他想逃走，答應進行 3 對 3 對戰！小智最先派出的是藤藤蛇！而修帝派出的是藤藤蛇的進化型，青藤蛇！第 3 次的勁敵對戰，會由誰獲勝！？
第32集：藍蟾蜍、泥巴魚！水邊的戰鬥！！2011年5月19日
在與修帝對戰時，小智發現到水水獺的意外弱點，那就是「在水中睜不開眼睛」。為了立刻開始特訓，它們來到一個大水池！小智將其他同伴交給艾莉絲照顧，陪著水水獺特訓，但是卻一直沒有成果。同一時間，艾莉絲放任神奇寶貝四處玩耍，可是滑頭小子竟然對躲在草叢中的「蘑菇神奇寶貝」寶貝球菇"使出鐵頭功！結果，生氣的寶貝球菇對大家噴出毒粉末，讓大家都中毒倒地！附近沒有神奇寶貝中心，在這種危急狀況下，能依靠的只有水水獺……最後到底會怎麼樣呢！？
第33集：龍之破壞者登場 艾莉絲與龍頭地鼠2011年5月26日
在前往雷文市的旅途中，突然出現一名攔路挑釁的少女‧藍葛雷。她的目標是來自龍之鄉的艾莉絲！藍葛雷似乎是被稱為「龍之破壞者」的冰系訓練家，而且好像是為了與艾莉絲對戰而刻意埋伏等待。受到囂張挑釁讓艾莉絲非常憤怒，決定答應進行對戰！藍葛雷派出的是「結凍神奇寶貝」凍原熊。艾莉絲則是理所當然地選了牙牙應戰！可是，不只是適性不佳，遇上凍原熊壓倒性的力量，牙牙一下子就失去戰鬥能力。懊悔不已的艾莉絲，對小智他們說出了藏在心裡的想法……
第34集：石丸子！發射電炮光澤吧！2011年6月2日
繼續踏上旅程前往雷文市的小智一行人，在某座森林休息。這時候，冒出了一隻「地幔神奇寶貝」石丸子，而且大鬧一場！它的舉動挑起小智的收服意願，馬上派出水水獺、暖暖豬應戰，沒想到卻慘敗！最後還不得不到神奇寶貝中心去治療。石丸子看著一行人離去，而它會大鬧似乎是有原因的……結束治療後，大家與喬伊小姐聊天的時候，有位男性出現了。他好像是來為突然斷水的神奇寶貝中心維修管線。但是，建築物內都沒有問題，原因似乎出現洞窟的水源。而且，這個水源地似乎隱藏著不得了的秘密！！
第35集：酒侍偵探天桐！差不多娃娃失蹤事件！2011年6月9日
持續旅行的小智一行人，在濃霧瀰漫的森林中迷路了。這時眼前出現人影……大夥兒為了問路靠過去，才發現那是「聽力神奇寶貝」差不多娃娃！可是，它看起來不太對勁，完全無視小智他們，搖搖晃晃的走掉了。大家正急著要追上去時，君莎小姐卻像要攔路一樣的出現了。而且，她竟然還說要逮捕小智一行人！大家想盡辦法解開君莎小姐的誤會，向她打聽詳細的狀況。根據她的說法，城鎮裡各處的差不多娃娃都突然失蹤了！小智等人也決定協助處理這種異常狀態！可是，這個事件卻有著意想不到的結局！！
第36集：化石復活！古代怪鳥始祖大鳥！2011年6月16日
小智一行人，在某個城鎮與紅豆杉博士及真菰博士重逢。2 位博士正打算以「羽之化石」讓「最古鳥神奇寶貝」始祖小鳥復活。將化石放入巨大機械中按下開關、靠夢夢蝕的能量將出力提高後，伴隨著機械中傳來的吵雜叫聲，一隻始祖小鳥出現了！只是，才剛醒過來、處於興奮狀態的始祖小鳥向各處胡亂使出「龍吸」！成功安撫始祖小鳥的是小智一行人。感情融洽的小智與始祖小鳥展開了飛上天的特訓，火箭隊卻在這時出現……
第37集：釣魚酒侍‧天桐登場！2011年6月23日
繼續旅行的小智一行人，又遇到那個很吵鬧的人物……被猛力撞上的小智，照例摔進了河中。一直鞠躬道歉的少女，原來是白露！她是為了報名參加附近城鎮的釣魚大賽而急著趕路。天桐一聽說這件事就徹底變臉！他似乎是熱愛釣魚到有了釣魚酒侍的別名。敗在幹勁十足的天桐的氣勢下，於是大家和白露一起去登記參賽。在河邊特別設定的會場裡，有一大群充滿活力的水系神奇寶貝！可是，這場釣魚大會隱藏了某個秘密…
第38集：索羅亞電影！神奇寶貝騎士傳說！2011年6月30日
小智他們在半路經過的電影院，有了驚人的邂逅！竟然有「惡狐神奇寶貝」索羅亞出現！訓練家路克總是用這隻愛變成電影女主角的索羅亞當主角拍電影，受到他的邀請，小智一行人也一起參加了電影拍攝！小智演出的，是為了解救索羅亞扮演的公主，勇敢對抗海盜天桐的神奇寶貝騎士！一邊為不習慣的演戲苦戰，一邊努力拍到了劇情高潮場景，也就是完成在傳說的龍之大師‧艾莉絲指導下的修行，終於要與天桐決戰的時刻！可是這時候，出現意想不到的人來搗亂，讓電影陷入作廢的危機……
第39集：全體集合！東‧喬治對戰！2011年7月7日
完成電影拍攝工作的小智一行人，為了參加東‧喬治主辦的「東‧喬治對戰」，與路克一起來到了雷文鎮。至今在旅途中遇到的訓練家們也都齊聚一堂！名字很容易叫錯的甘尼洋、神奇寶貝酒侍赤霞珠、龍之破壞者藍葛雷、吵吵鬧鬧的白露，還有勁敵‧修帝！而且連天桐、艾莉絲與路克都決定參賽，小智的鬥志飆到最高點！伴隨著東‧喬治的開賽宣言，對戰分組也陸續出爐。終於到了發表小智對戰對手的時候，螢幕上應出來的，竟然是……
第40集：激戰東‧喬治對戰 藤藤蛇 VS 駒刀小兵2011年7月21日
雷文鎮的「東‧喬治對戰」終於開始了。在神奇寶貝對戰俱樂部的東‧喬治所主辦的這場對戰錦標賽中，小智與碧霞珠展開對戰！大顯身手的藍蟾蜍讓小智漂亮的通過第一輪。但是，從天桐 VS 修帝、白露 VS 甘尼洋開始，第一輪就接連出現火熱的對戰！繼藍葛雷、安東尼、小智之後，能夠晉級第 2 輪的究竟是誰？接著發表的第2輪對戰分組，小智的對手出人意料的是！而藤藤蛇也面臨危機！？小智慧夠扳倒強敵、順利的打入東‧喬治對戰的準決賽嗎？而最後獲勝的又會是誰……
第41集：火熱的東喬治對戰導電飛鼠 VS 打擊鬼2011年8月4日
雷文鎮神奇寶貝對戰俱樂部的東‧喬治舉辦了對戰錦標賽「東‧喬治對戰」。小智在第 2 輪與龍之破壞者‧藍葛雷展開激戰，被逼入走投無路的絕境。藍葛雷的駒刀小兵銳利的攻擊，讓小智的藤藤蛇苦於應對。小智慧夠突破這個危機，晉級準決賽嗎！？ 隨後上場的是天桐 VS 路克、艾莉絲 VS 甘尼洋的對戰。天桐的泥巴魚與路克的燃燒蟲、艾莉絲的導電飛鼠與甘尼洋的打擊鬼火花四射的猛烈衝突！白熱化的對戰之後，贏得準決賽的人物，究竟是誰！？
第42集：決戰 東‧喬治對戰！小智對艾莉絲2011年8月11日
東‧喬治舉辦了對戰錦標賽「東‧喬治對戰」。小智一路過關斬將，朝著決賽前進。接下來的準決賽第 2 場比賽是艾莉絲 VS 路克。艾莉絲的牙牙在大賽中初次參加對戰賽，路克的泥偶小人發出的連續攻擊令它束手無策，陷入只能閃躲逃避的危機。可是，牙牙在緊要關頭使出了新絕招，漂亮的逆轉擊敗路克的泥偶小人，讓艾莉絲拿下通往決賽的門票。到了決賽，小智與艾莉絲展開了熾烈的對戰！小智‧艾莉絲在決賽中會選擇什麼神奇寶貝！？稱霸命運之戰，成為東‧喬治對戰優勝者的到底是誰！？
第43集：交涉喵‧喵喵 頭巾混混說服作戰2011年8月18日
小智他們為了達成得到第 4 個徽章的目標，繼續旅行前往下一間道館的所在地雷文市……可是，他們發現火箭隊的喵喵遍體鱗傷地倒在路邊。在小智等人的治療下，喵喵恢復了意識。喵喵說，它是因為執行任務失敗而被總部宣佈開除，與武藏、小次郎分道揚鑣，身心俱疲的四處流浪。看到喵喵這個樣子，小智、艾莉絲與天桐提議要它跟大家一起旅行。喵喵也決定答應不再做壞事的約定，加入他們旅行。這時候，牙牙被頭巾混混綁走了！？
第44集：小心扒手貓！喵喵與水水獺！！2011年8月25日
因緣際會下開始與喵喵一起旅行的小智他們，遇上了一隻扒手貓。一眼就被「刁蠻神奇寶貝」扒手貓的可愛模樣迷倒，喵喵與水水獺竟然為了吸引扒手貓的注意，展開了追求大戰。扒手貓則對它們表示自己的朋友被困在洞窟，拜託它們前去幫忙。以前曾經在扒手貓手下吃過苦頭的天桐，表明了他不信任對方的立場。但是，小智和艾莉絲還有喵喵和水水獺相信扒手貓，決定跟著它到洞窟去！？
第45集：大宇怪與雙卵細胞球與夢境小偷！！2011年9月1日
小智一行人帶著喵喵這個新成員，一起前往雷文市。因為天色暗了下來，一行人開始準備露營，喵喵則去尋找適合當柴火的樹枝。在喵喵找不太到適當枯枝的時候，「腦神奇寶貝」大宇怪出現，送給它一整捆木柴。大宇怪表示「可以幫大家實現任何願望」，提供了現在正缺少的食材。看到這情景，天桐說出了希望在度假飯店套房好好睡一覺的願望。跟著大宇怪走的小智一行人，在應該什麼都沒有的森林中找到一家氣派的度假飯店。 雖然感到不可思議，他們還是住了下來，可是……
第46集：交涉喵‧喵喵！ 突破凍原熊的森林吧2011年9月8日
在前往雷文市的途中，小智一行人來到了某座山上。當他們在因為暴風雨而一片混亂的山路上前進時，發現了倒在路邊的「結冰神奇寶貝」噴嚏熊。為了讓噴嚏熊回覆體力，大家分頭去找食物，但是就在終於找到樹果時，「結凍神奇寶貝」凍原熊出現了。喵喵以交涉喵的身分介入，想要安撫激動的凍原熊，可是凍原熊卻毫不留情地使出「凍風」攻擊過來。在山林保安官克力弗的神奇寶貝「武術神奇寶貝」功夫鼬幫忙下，驚險逃過一劫的他們，能夠順利讓噴嚏熊回到原本的族群嗎！？
第47集：疾奔！對戰地下鐵！（前篇）2011年9月15日
抵達雷文市的一行人，搭乘地下鐵前往神奇寶貝中心。天桐這個地下鐵酒侍興奮不已地凝視著駕駛座，但是列車卻突然緊急停車。往窗外一看，隔壁的軌道上有從未見過的車型駛過。他們在查探時，與管理雷文市地下鐵的地下鐵總控官北尚、南廈會合。根據兩人的說法，最近出現了不在時刻表上的「幽靈列車」。雖然很在意幽靈列車的真面目，一行人還是前往神奇寶貝中心。聽說提供了平常的神奇寶貝中心沒有的，讓神奇寶貝身心都獲得療愈的特別服務，小智一行人決定把所有神奇寶貝都寄放在這，結果卻是！？
第48集：疾奔！對戰地下鐵!!（後篇）2011年9月15日
抵達雷文市的一行人，搭乘地下鐵前往神奇寶貝中心。天桐這個地下鐵酒侍興奮不已地凝視著駕駛座，但是列車卻突然緊急停車。往窗外一看，隔壁的軌道上有從未見過的車型駛過。他們在查探時，與管理雷文市地下鐵的地下鐵總控官北尚、南廈會合。根據兩人的說法，最近出現了不在時刻表上的「幽靈列車」。雖然很在意幽靈列車的真面目，一行人還是前往神奇寶貝中心。聽說提供了平常的神奇寶貝中心沒有的，讓神奇寶貝身心都獲得療愈的特別服務，小智一行人決定把所有神奇寶貝都寄放在這，結果卻是！？